Protein–RNA interactions for Protein: Q6PF15

KLHL35, Kelch-like protein 35, humanhuman

Predictions only

Length 583 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL35Q6PF15 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
KLHL35Q6PF15 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
KLHL35Q6PF15 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
KLHL35Q6PF15 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
KLHL35Q6PF15 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
KLHL35Q6PF15 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
KLHL35Q6PF15 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
KLHL35Q6PF15 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
KLHL35Q6PF15 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
KLHL35Q6PF15 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
KLHL35Q6PF15 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
KLHL35Q6PF15 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
KLHL35Q6PF15 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
KLHL35Q6PF15 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
KLHL35Q6PF15 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC19.62■□□□□ 0.73
KLHL35Q6PF15 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
KLHL35Q6PF15 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
KLHL35Q6PF15 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
KLHL35Q6PF15 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
KLHL35Q6PF15 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
KLHL35Q6PF15 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
KLHL35Q6PF15 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
KLHL35Q6PF15 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
KLHL35Q6PF15 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
KLHL35Q6PF15 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
KLHL35Q6PF15 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
KLHL35Q6PF15 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
KLHL35Q6PF15 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
KLHL35Q6PF15 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
KLHL35Q6PF15 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
KLHL35Q6PF15 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
KLHL35Q6PF15 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
KLHL35Q6PF15 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
KLHL35Q6PF15 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
KLHL35Q6PF15 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
KLHL35Q6PF15 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC19.61■□□□□ 0.73
KLHL35Q6PF15 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
KLHL35Q6PF15 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
KLHL35Q6PF15 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.61■□□□□ 0.73
KLHL35Q6PF15 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
KLHL35Q6PF15 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
KLHL35Q6PF15 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
KLHL35Q6PF15 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
KLHL35Q6PF15 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
KLHL35Q6PF15 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
KLHL35Q6PF15 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
KLHL35Q6PF15 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
KLHL35Q6PF15 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
KLHL35Q6PF15 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
KLHL35Q6PF15 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
KLHL35Q6PF15 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
KLHL35Q6PF15 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
KLHL35Q6PF15 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
KLHL35Q6PF15 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
KLHL35Q6PF15 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
KLHL35Q6PF15 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
KLHL35Q6PF15 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
KLHL35Q6PF15 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
KLHL35Q6PF15 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
KLHL35Q6PF15 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
KLHL35Q6PF15 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
KLHL35Q6PF15 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
KLHL35Q6PF15 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
KLHL35Q6PF15 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC19.6■□□□□ 0.73
KLHL35Q6PF15 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
KLHL35Q6PF15 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
KLHL35Q6PF15 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
KLHL35Q6PF15 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
KLHL35Q6PF15 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
KLHL35Q6PF15 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
KLHL35Q6PF15 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
KLHL35Q6PF15 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
KLHL35Q6PF15 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
KLHL35Q6PF15 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
KLHL35Q6PF15 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
KLHL35Q6PF15 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
KLHL35Q6PF15 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
KLHL35Q6PF15 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
KLHL35Q6PF15 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
KLHL35Q6PF15 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
KLHL35Q6PF15 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
KLHL35Q6PF15 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
KLHL35Q6PF15 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
KLHL35Q6PF15 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
KLHL35Q6PF15 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
KLHL35Q6PF15 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
KLHL35Q6PF15 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
KLHL35Q6PF15 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
KLHL35Q6PF15 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
KLHL35Q6PF15 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
KLHL35Q6PF15 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
KLHL35Q6PF15 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
KLHL35Q6PF15 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
KLHL35Q6PF15 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
KLHL35Q6PF15 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
KLHL35Q6PF15 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
KLHL35Q6PF15 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
KLHL35Q6PF15 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
KLHL35Q6PF15 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
KLHL35Q6PF15 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.8 ms