Protein–RNA interactions for Protein: Q6NXP0

EFCAB12, EF-hand calcium-binding domain-containing protein 12, humanhuman

Predictions only

Length 572 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFCAB12Q6NXP0 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
EFCAB12Q6NXP0 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
EFCAB12Q6NXP0 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
EFCAB12Q6NXP0 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
EFCAB12Q6NXP0 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
EFCAB12Q6NXP0 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
EFCAB12Q6NXP0 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
EFCAB12Q6NXP0 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
EFCAB12Q6NXP0 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
EFCAB12Q6NXP0 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
EFCAB12Q6NXP0 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
EFCAB12Q6NXP0 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
EFCAB12Q6NXP0 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
EFCAB12Q6NXP0 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
EFCAB12Q6NXP0 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
EFCAB12Q6NXP0 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
EFCAB12Q6NXP0 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
EFCAB12Q6NXP0 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
EFCAB12Q6NXP0 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
EFCAB12Q6NXP0 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
EFCAB12Q6NXP0 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
EFCAB12Q6NXP0 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
EFCAB12Q6NXP0 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
EFCAB12Q6NXP0 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
EFCAB12Q6NXP0 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
EFCAB12Q6NXP0 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
EFCAB12Q6NXP0 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
EFCAB12Q6NXP0 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
EFCAB12Q6NXP0 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
EFCAB12Q6NXP0 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
EFCAB12Q6NXP0 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
EFCAB12Q6NXP0 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
EFCAB12Q6NXP0 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
EFCAB12Q6NXP0 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
EFCAB12Q6NXP0 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
EFCAB12Q6NXP0 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
EFCAB12Q6NXP0 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
EFCAB12Q6NXP0 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
EFCAB12Q6NXP0 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
EFCAB12Q6NXP0 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
EFCAB12Q6NXP0 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
EFCAB12Q6NXP0 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
EFCAB12Q6NXP0 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
EFCAB12Q6NXP0 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
EFCAB12Q6NXP0 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
EFCAB12Q6NXP0 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
EFCAB12Q6NXP0 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
EFCAB12Q6NXP0 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
EFCAB12Q6NXP0 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
EFCAB12Q6NXP0 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
EFCAB12Q6NXP0 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
EFCAB12Q6NXP0 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
EFCAB12Q6NXP0 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
EFCAB12Q6NXP0 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
EFCAB12Q6NXP0 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
EFCAB12Q6NXP0 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC21.95■■□□□ 1.1
EFCAB12Q6NXP0 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
EFCAB12Q6NXP0 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC21.95■■□□□ 1.1
EFCAB12Q6NXP0 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
EFCAB12Q6NXP0 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
EFCAB12Q6NXP0 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
EFCAB12Q6NXP0 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
EFCAB12Q6NXP0 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
EFCAB12Q6NXP0 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
EFCAB12Q6NXP0 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
EFCAB12Q6NXP0 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
EFCAB12Q6NXP0 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
EFCAB12Q6NXP0 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
EFCAB12Q6NXP0 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
EFCAB12Q6NXP0 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
EFCAB12Q6NXP0 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
EFCAB12Q6NXP0 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
EFCAB12Q6NXP0 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
EFCAB12Q6NXP0 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
EFCAB12Q6NXP0 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
EFCAB12Q6NXP0 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
EFCAB12Q6NXP0 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
EFCAB12Q6NXP0 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
EFCAB12Q6NXP0 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
EFCAB12Q6NXP0 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
EFCAB12Q6NXP0 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
EFCAB12Q6NXP0 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
EFCAB12Q6NXP0 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
EFCAB12Q6NXP0 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
EFCAB12Q6NXP0 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
EFCAB12Q6NXP0 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
EFCAB12Q6NXP0 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
EFCAB12Q6NXP0 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
EFCAB12Q6NXP0 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
EFCAB12Q6NXP0 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
EFCAB12Q6NXP0 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
EFCAB12Q6NXP0 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
EFCAB12Q6NXP0 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
EFCAB12Q6NXP0 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
EFCAB12Q6NXP0 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
EFCAB12Q6NXP0 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
EFCAB12Q6NXP0 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
EFCAB12Q6NXP0 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
EFCAB12Q6NXP0 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
EFCAB12Q6NXP0 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.9 ms