Protein–RNA interactions for Protein: Q5T700

LDLRAD1, Low-density lipoprotein receptor class A domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LDLRAD1Q5T700 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
LDLRAD1Q5T700 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
LDLRAD1Q5T700 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
LDLRAD1Q5T700 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
LDLRAD1Q5T700 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
LDLRAD1Q5T700 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
LDLRAD1Q5T700 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
LDLRAD1Q5T700 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
LDLRAD1Q5T700 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
LDLRAD1Q5T700 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
LDLRAD1Q5T700 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
LDLRAD1Q5T700 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
LDLRAD1Q5T700 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
LDLRAD1Q5T700 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
LDLRAD1Q5T700 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
LDLRAD1Q5T700 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
LDLRAD1Q5T700 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
LDLRAD1Q5T700 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
LDLRAD1Q5T700 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC23.23■■□□□ 1.31
LDLRAD1Q5T700 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
LDLRAD1Q5T700 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
LDLRAD1Q5T700 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
LDLRAD1Q5T700 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
LDLRAD1Q5T700 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
LDLRAD1Q5T700 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
LDLRAD1Q5T700 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
LDLRAD1Q5T700 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
LDLRAD1Q5T700 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
LDLRAD1Q5T700 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
LDLRAD1Q5T700 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
LDLRAD1Q5T700 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
LDLRAD1Q5T700 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
LDLRAD1Q5T700 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
LDLRAD1Q5T700 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
LDLRAD1Q5T700 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
LDLRAD1Q5T700 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
LDLRAD1Q5T700 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
LDLRAD1Q5T700 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
LDLRAD1Q5T700 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
LDLRAD1Q5T700 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
LDLRAD1Q5T700 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
LDLRAD1Q5T700 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
LDLRAD1Q5T700 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
LDLRAD1Q5T700 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
LDLRAD1Q5T700 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
LDLRAD1Q5T700 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
LDLRAD1Q5T700 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
LDLRAD1Q5T700 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
LDLRAD1Q5T700 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
LDLRAD1Q5T700 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
LDLRAD1Q5T700 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
LDLRAD1Q5T700 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
LDLRAD1Q5T700 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC23.21■■□□□ 1.31
LDLRAD1Q5T700 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
LDLRAD1Q5T700 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
LDLRAD1Q5T700 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
LDLRAD1Q5T700 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
LDLRAD1Q5T700 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
LDLRAD1Q5T700 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
LDLRAD1Q5T700 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
LDLRAD1Q5T700 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
LDLRAD1Q5T700 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
LDLRAD1Q5T700 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
LDLRAD1Q5T700 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
LDLRAD1Q5T700 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
LDLRAD1Q5T700 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
LDLRAD1Q5T700 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
LDLRAD1Q5T700 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
LDLRAD1Q5T700 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
LDLRAD1Q5T700 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
LDLRAD1Q5T700 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
LDLRAD1Q5T700 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
LDLRAD1Q5T700 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
LDLRAD1Q5T700 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
LDLRAD1Q5T700 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
LDLRAD1Q5T700 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
LDLRAD1Q5T700 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
LDLRAD1Q5T700 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
LDLRAD1Q5T700 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
LDLRAD1Q5T700 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
LDLRAD1Q5T700 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
LDLRAD1Q5T700 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
LDLRAD1Q5T700 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
LDLRAD1Q5T700 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
LDLRAD1Q5T700 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
LDLRAD1Q5T700 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
LDLRAD1Q5T700 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
LDLRAD1Q5T700 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
LDLRAD1Q5T700 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
LDLRAD1Q5T700 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
LDLRAD1Q5T700 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
LDLRAD1Q5T700 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
LDLRAD1Q5T700 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
LDLRAD1Q5T700 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
LDLRAD1Q5T700 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
LDLRAD1Q5T700 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
LDLRAD1Q5T700 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
LDLRAD1Q5T700 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
LDLRAD1Q5T700 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
LDLRAD1Q5T700 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.9 ms