Protein–RNA interactions for Protein: Q3SY46

KRTAP13-3, Keratin-associated protein 13-3, humanhuman

Predictions only

Length 172 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP13-3Q3SY46 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
KRTAP13-3Q3SY46 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
KRTAP13-3Q3SY46 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
KRTAP13-3Q3SY46 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
KRTAP13-3Q3SY46 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
KRTAP13-3Q3SY46 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
KRTAP13-3Q3SY46 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.31□□□□□ -0.6
KRTAP13-3Q3SY46 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.31□□□□□ -0.6
KRTAP13-3Q3SY46 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
KRTAP13-3Q3SY46 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC11.31□□□□□ -0.6
KRTAP13-3Q3SY46 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
KRTAP13-3Q3SY46 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
KRTAP13-3Q3SY46 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
KRTAP13-3Q3SY46 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
KRTAP13-3Q3SY46 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
KRTAP13-3Q3SY46 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
KRTAP13-3Q3SY46 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
KRTAP13-3Q3SY46 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
KRTAP13-3Q3SY46 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
KRTAP13-3Q3SY46 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
KRTAP13-3Q3SY46 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
KRTAP13-3Q3SY46 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
KRTAP13-3Q3SY46 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
KRTAP13-3Q3SY46 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
KRTAP13-3Q3SY46 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
KRTAP13-3Q3SY46 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
KRTAP13-3Q3SY46 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
KRTAP13-3Q3SY46 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
KRTAP13-3Q3SY46 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC11.3□□□□□ -0.6
KRTAP13-3Q3SY46 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
KRTAP13-3Q3SY46 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
KRTAP13-3Q3SY46 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
KRTAP13-3Q3SY46 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
KRTAP13-3Q3SY46 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
KRTAP13-3Q3SY46 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
KRTAP13-3Q3SY46 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
KRTAP13-3Q3SY46 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
KRTAP13-3Q3SY46 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
KRTAP13-3Q3SY46 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
KRTAP13-3Q3SY46 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
KRTAP13-3Q3SY46 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
KRTAP13-3Q3SY46 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
KRTAP13-3Q3SY46 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
KRTAP13-3Q3SY46 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
KRTAP13-3Q3SY46 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
KRTAP13-3Q3SY46 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
KRTAP13-3Q3SY46 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
KRTAP13-3Q3SY46 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
KRTAP13-3Q3SY46 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
KRTAP13-3Q3SY46 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
KRTAP13-3Q3SY46 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
KRTAP13-3Q3SY46 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
KRTAP13-3Q3SY46 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
KRTAP13-3Q3SY46 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
KRTAP13-3Q3SY46 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
KRTAP13-3Q3SY46 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
KRTAP13-3Q3SY46 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
KRTAP13-3Q3SY46 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
KRTAP13-3Q3SY46 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
KRTAP13-3Q3SY46 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
KRTAP13-3Q3SY46 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC11.29□□□□□ -0.6
KRTAP13-3Q3SY46 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
KRTAP13-3Q3SY46 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
KRTAP13-3Q3SY46 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.29□□□□□ -0.6
KRTAP13-3Q3SY46 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
KRTAP13-3Q3SY46 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
KRTAP13-3Q3SY46 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC11.29□□□□□ -0.6
KRTAP13-3Q3SY46 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
KRTAP13-3Q3SY46 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
KRTAP13-3Q3SY46 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
KRTAP13-3Q3SY46 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
KRTAP13-3Q3SY46 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
KRTAP13-3Q3SY46 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
KRTAP13-3Q3SY46 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
KRTAP13-3Q3SY46 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC11.29□□□□□ -0.6
KRTAP13-3Q3SY46 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
KRTAP13-3Q3SY46 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
KRTAP13-3Q3SY46 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
KRTAP13-3Q3SY46 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
KRTAP13-3Q3SY46 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
KRTAP13-3Q3SY46 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
KRTAP13-3Q3SY46 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
KRTAP13-3Q3SY46 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
KRTAP13-3Q3SY46 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
KRTAP13-3Q3SY46 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
KRTAP13-3Q3SY46 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
KRTAP13-3Q3SY46 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
KRTAP13-3Q3SY46 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
KRTAP13-3Q3SY46 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
KRTAP13-3Q3SY46 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
KRTAP13-3Q3SY46 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
KRTAP13-3Q3SY46 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
KRTAP13-3Q3SY46 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
KRTAP13-3Q3SY46 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
KRTAP13-3Q3SY46 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
KRTAP13-3Q3SY46 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
KRTAP13-3Q3SY46 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
KRTAP13-3Q3SY46 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
KRTAP13-3Q3SY46 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
KRTAP13-3Q3SY46 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31 ms