Protein–RNA interactions for Protein: Q2TBA0

KLHL40, Kelch-like protein 40, humanhuman

Predictions only

Length 621 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL40Q2TBA0 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
KLHL40Q2TBA0 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
KLHL40Q2TBA0 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
KLHL40Q2TBA0 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
KLHL40Q2TBA0 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
KLHL40Q2TBA0 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
KLHL40Q2TBA0 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
KLHL40Q2TBA0 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
KLHL40Q2TBA0 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
KLHL40Q2TBA0 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
KLHL40Q2TBA0 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
KLHL40Q2TBA0 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
KLHL40Q2TBA0 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
KLHL40Q2TBA0 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
KLHL40Q2TBA0 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
KLHL40Q2TBA0 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
KLHL40Q2TBA0 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
KLHL40Q2TBA0 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
KLHL40Q2TBA0 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
KLHL40Q2TBA0 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
KLHL40Q2TBA0 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
KLHL40Q2TBA0 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
KLHL40Q2TBA0 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
KLHL40Q2TBA0 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
KLHL40Q2TBA0 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
KLHL40Q2TBA0 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
KLHL40Q2TBA0 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
KLHL40Q2TBA0 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
KLHL40Q2TBA0 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
KLHL40Q2TBA0 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
KLHL40Q2TBA0 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
KLHL40Q2TBA0 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
KLHL40Q2TBA0 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
KLHL40Q2TBA0 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
KLHL40Q2TBA0 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
KLHL40Q2TBA0 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
KLHL40Q2TBA0 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
KLHL40Q2TBA0 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
KLHL40Q2TBA0 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
KLHL40Q2TBA0 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
KLHL40Q2TBA0 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
KLHL40Q2TBA0 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
KLHL40Q2TBA0 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
KLHL40Q2TBA0 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
KLHL40Q2TBA0 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
KLHL40Q2TBA0 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
KLHL40Q2TBA0 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
KLHL40Q2TBA0 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
KLHL40Q2TBA0 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
KLHL40Q2TBA0 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
KLHL40Q2TBA0 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
KLHL40Q2TBA0 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
KLHL40Q2TBA0 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
KLHL40Q2TBA0 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
KLHL40Q2TBA0 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
KLHL40Q2TBA0 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
KLHL40Q2TBA0 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
KLHL40Q2TBA0 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
KLHL40Q2TBA0 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
KLHL40Q2TBA0 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
KLHL40Q2TBA0 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
KLHL40Q2TBA0 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
KLHL40Q2TBA0 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
KLHL40Q2TBA0 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
KLHL40Q2TBA0 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
KLHL40Q2TBA0 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
KLHL40Q2TBA0 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
KLHL40Q2TBA0 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
KLHL40Q2TBA0 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
KLHL40Q2TBA0 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
KLHL40Q2TBA0 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
KLHL40Q2TBA0 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
KLHL40Q2TBA0 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
KLHL40Q2TBA0 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
KLHL40Q2TBA0 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
KLHL40Q2TBA0 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
KLHL40Q2TBA0 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
KLHL40Q2TBA0 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
KLHL40Q2TBA0 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
KLHL40Q2TBA0 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
KLHL40Q2TBA0 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
KLHL40Q2TBA0 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
KLHL40Q2TBA0 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
KLHL40Q2TBA0 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
KLHL40Q2TBA0 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
KLHL40Q2TBA0 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
KLHL40Q2TBA0 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
KLHL40Q2TBA0 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
KLHL40Q2TBA0 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
KLHL40Q2TBA0 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
KLHL40Q2TBA0 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
KLHL40Q2TBA0 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
KLHL40Q2TBA0 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
KLHL40Q2TBA0 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
KLHL40Q2TBA0 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
KLHL40Q2TBA0 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
KLHL40Q2TBA0 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
KLHL40Q2TBA0 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
KLHL40Q2TBA0 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
KLHL40Q2TBA0 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.2 ms