Protein–RNA interactions for Protein: Q1XH10

SKIDA1, SKI/DACH domain-containing protein 1, humanhuman

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Length 827 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKIDA1Q1XH10 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SKIDA1Q1XH10 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SKIDA1Q1XH10 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SKIDA1Q1XH10 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SKIDA1Q1XH10 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SKIDA1Q1XH10 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
SKIDA1Q1XH10 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SKIDA1Q1XH10 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SKIDA1Q1XH10 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SKIDA1Q1XH10 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SKIDA1Q1XH10 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SKIDA1Q1XH10 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SKIDA1Q1XH10 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SKIDA1Q1XH10 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SKIDA1Q1XH10 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SKIDA1Q1XH10 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SKIDA1Q1XH10 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SKIDA1Q1XH10 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SKIDA1Q1XH10 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SKIDA1Q1XH10 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SKIDA1Q1XH10 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SKIDA1Q1XH10 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
SKIDA1Q1XH10 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SKIDA1Q1XH10 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC21.05■□□□□ 0.96
SKIDA1Q1XH10 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SKIDA1Q1XH10 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
SKIDA1Q1XH10 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
SKIDA1Q1XH10 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SKIDA1Q1XH10 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
SKIDA1Q1XH10 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC21.05■□□□□ 0.96
SKIDA1Q1XH10 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SKIDA1Q1XH10 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
SKIDA1Q1XH10 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SKIDA1Q1XH10 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
SKIDA1Q1XH10 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SKIDA1Q1XH10 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
SKIDA1Q1XH10 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
SKIDA1Q1XH10 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SKIDA1Q1XH10 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SKIDA1Q1XH10 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SKIDA1Q1XH10 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SKIDA1Q1XH10 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SKIDA1Q1XH10 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
SKIDA1Q1XH10 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC21.04■□□□□ 0.96
SKIDA1Q1XH10 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SKIDA1Q1XH10 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SKIDA1Q1XH10 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
SKIDA1Q1XH10 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SKIDA1Q1XH10 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SKIDA1Q1XH10 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SKIDA1Q1XH10 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SKIDA1Q1XH10 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SKIDA1Q1XH10 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
SKIDA1Q1XH10 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
SKIDA1Q1XH10 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SKIDA1Q1XH10 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
SKIDA1Q1XH10 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
SKIDA1Q1XH10 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
SKIDA1Q1XH10 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
SKIDA1Q1XH10 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
SKIDA1Q1XH10 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
SKIDA1Q1XH10 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC21.03■□□□□ 0.96
SKIDA1Q1XH10 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
SKIDA1Q1XH10 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SKIDA1Q1XH10 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SKIDA1Q1XH10 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SKIDA1Q1XH10 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SKIDA1Q1XH10 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
SKIDA1Q1XH10 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
SKIDA1Q1XH10 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SKIDA1Q1XH10 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
SKIDA1Q1XH10 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SKIDA1Q1XH10 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
SKIDA1Q1XH10 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
SKIDA1Q1XH10 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
SKIDA1Q1XH10 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
SKIDA1Q1XH10 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
SKIDA1Q1XH10 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
SKIDA1Q1XH10 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
SKIDA1Q1XH10 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
SKIDA1Q1XH10 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
SKIDA1Q1XH10 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
SKIDA1Q1XH10 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
SKIDA1Q1XH10 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
SKIDA1Q1XH10 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC21.02■□□□□ 0.96
SKIDA1Q1XH10 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
SKIDA1Q1XH10 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
SKIDA1Q1XH10 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
SKIDA1Q1XH10 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
SKIDA1Q1XH10 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
SKIDA1Q1XH10 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
SKIDA1Q1XH10 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
SKIDA1Q1XH10 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
SKIDA1Q1XH10 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
SKIDA1Q1XH10 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
SKIDA1Q1XH10 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
SKIDA1Q1XH10 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
SKIDA1Q1XH10 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SKIDA1Q1XH10 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SKIDA1Q1XH10 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
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