Protein–RNA interactions for Protein: Q1T7F1

Putative chemokine-related protein B42, humanhuman

Predictions only

Length 81 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q1T7F1 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Q1T7F1 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Q1T7F1 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Q1T7F1 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Q1T7F1 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Q1T7F1 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Q1T7F1 MCF2L-208ENST00000397030 6580 ntTSL 2 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Q1T7F1 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Q1T7F1 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Q1T7F1 ELN-221ENST00000445912 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Q1T7F1 PBX1-219ENST00000560641 3225 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Q1T7F1 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Q1T7F1 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Q1T7F1 ADAMTS18-201ENST00000282849 5913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Q1T7F1 ST14-201ENST00000278742 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Q1T7F1 CREBBP-201ENST00000262367 10803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Q1T7F1 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Q1T7F1 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Q1T7F1 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Q1T7F1 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Q1T7F1 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Q1T7F1 ORAI2-205ENST00000478730 5531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Q1T7F1 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Q1T7F1 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Q1T7F1 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Q1T7F1 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Q1T7F1 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Q1T7F1 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Q1T7F1 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Q1T7F1 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Q1T7F1 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Q1T7F1 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Q1T7F1 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Q1T7F1 NPHP3-201ENST00000337331 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Q1T7F1 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Q1T7F1 PEX6-202ENST00000304611 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Q1T7F1 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Q1T7F1 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Q1T7F1 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Q1T7F1 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Q1T7F1 TDRD6-203ENST00000544460 8887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Q1T7F1 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Q1T7F1 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Q1T7F1 KAZN-201ENST00000361144 3838 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Q1T7F1 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Q1T7F1 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Q1T7F1 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Q1T7F1 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Q1T7F1 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Q1T7F1 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Q1T7F1 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Q1T7F1 RAB22A-201ENST00000244040 8670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Q1T7F1 ME2-201ENST00000321341 9415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Q1T7F1 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Q1T7F1 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Q1T7F1 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Q1T7F1 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Q1T7F1 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Q1T7F1 PLPPR2-201ENST00000251473 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Q1T7F1 CASZ1-202ENST00000377022 7936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Q1T7F1 MGAT1-201ENST00000307826 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Q1T7F1 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Q1T7F1 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Q1T7F1 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Q1T7F1 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Q1T7F1 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Q1T7F1 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Q1T7F1 MTCL1-205ENST00000517570 6009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Q1T7F1 PAX6-203ENST00000379109 3182 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Q1T7F1 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Q1T7F1 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Q1T7F1 ZNF133-205ENST00000401790 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Q1T7F1 RBPMS-204ENST00000397323 2941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Q1T7F1 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Q1T7F1 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Q1T7F1 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Q1T7F1 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Q1T7F1 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Q1T7F1 SLC8A3-203ENST00000357887 5259 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Q1T7F1 SLC8A3-204ENST00000381269 5268 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Q1T7F1 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Q1T7F1 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Q1T7F1 C16orf89-201ENST00000315997 1872 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Q1T7F1 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Q1T7F1 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Q1T7F1 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Q1T7F1 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Q1T7F1 TIGD2-202ENST00000603357 3217 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Q1T7F1 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Q1T7F1 ITSN2-201ENST00000355123 6300 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Q1T7F1 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Q1T7F1 ASF1A-201ENST00000229595 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Q1T7F1 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Q1T7F1 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Q1T7F1 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Q1T7F1 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Q1T7F1 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Q1T7F1 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Q1T7F1 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Q1T7F1 FAM46A-201ENST00000320172 5609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.3 ms