Protein–RNA interactions for Protein: Q16667

CDKN3, Cyclin-dependent kinase inhibitor 3, humanhuman

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Length 212 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDKN3Q16667 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CDKN3Q16667 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CDKN3Q16667 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CDKN3Q16667 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
CDKN3Q16667 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CDKN3Q16667 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CDKN3Q16667 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CDKN3Q16667 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CDKN3Q16667 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CDKN3Q16667 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CDKN3Q16667 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CDKN3Q16667 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CDKN3Q16667 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CDKN3Q16667 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CDKN3Q16667 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CDKN3Q16667 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CDKN3Q16667 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CDKN3Q16667 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CDKN3Q16667 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CDKN3Q16667 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CDKN3Q16667 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CDKN3Q16667 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CDKN3Q16667 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CDKN3Q16667 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CDKN3Q16667 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CDKN3Q16667 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CDKN3Q16667 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CDKN3Q16667 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CDKN3Q16667 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CDKN3Q16667 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CDKN3Q16667 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CDKN3Q16667 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CDKN3Q16667 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CDKN3Q16667 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CDKN3Q16667 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CDKN3Q16667 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CDKN3Q16667 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CDKN3Q16667 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CDKN3Q16667 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CDKN3Q16667 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CDKN3Q16667 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CDKN3Q16667 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CDKN3Q16667 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CDKN3Q16667 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CDKN3Q16667 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CDKN3Q16667 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CDKN3Q16667 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CDKN3Q16667 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CDKN3Q16667 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CDKN3Q16667 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CDKN3Q16667 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CDKN3Q16667 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CDKN3Q16667 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CDKN3Q16667 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CDKN3Q16667 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CDKN3Q16667 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CDKN3Q16667 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CDKN3Q16667 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CDKN3Q16667 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CDKN3Q16667 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CDKN3Q16667 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CDKN3Q16667 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CDKN3Q16667 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CDKN3Q16667 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
CDKN3Q16667 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CDKN3Q16667 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CDKN3Q16667 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CDKN3Q16667 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CDKN3Q16667 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CDKN3Q16667 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CDKN3Q16667 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CDKN3Q16667 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CDKN3Q16667 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CDKN3Q16667 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CDKN3Q16667 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
CDKN3Q16667 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CDKN3Q16667 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CDKN3Q16667 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CDKN3Q16667 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CDKN3Q16667 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CDKN3Q16667 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CDKN3Q16667 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CDKN3Q16667 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CDKN3Q16667 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CDKN3Q16667 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
CDKN3Q16667 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
CDKN3Q16667 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CDKN3Q16667 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CDKN3Q16667 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CDKN3Q16667 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
CDKN3Q16667 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CDKN3Q16667 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CDKN3Q16667 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CDKN3Q16667 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
CDKN3Q16667 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CDKN3Q16667 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CDKN3Q16667 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
CDKN3Q16667 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CDKN3Q16667 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC19.91■□□□□ 0.78
CDKN3Q16667 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
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