Protein–RNA interactions for Protein: Q16585

SGCB, Beta-sarcoglycan, humanhuman

Predictions only

Length 318 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCBQ16585 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SGCBQ16585 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SGCBQ16585 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SGCBQ16585 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SGCBQ16585 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
SGCBQ16585 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SGCBQ16585 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SGCBQ16585 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SGCBQ16585 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SGCBQ16585 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SGCBQ16585 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SGCBQ16585 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SGCBQ16585 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SGCBQ16585 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SGCBQ16585 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SGCBQ16585 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SGCBQ16585 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SGCBQ16585 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SGCBQ16585 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SGCBQ16585 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SGCBQ16585 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SGCBQ16585 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SGCBQ16585 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SGCBQ16585 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SGCBQ16585 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SGCBQ16585 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SGCBQ16585 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SGCBQ16585 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SGCBQ16585 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SGCBQ16585 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SGCBQ16585 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SGCBQ16585 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SGCBQ16585 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SGCBQ16585 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
SGCBQ16585 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SGCBQ16585 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SGCBQ16585 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SGCBQ16585 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SGCBQ16585 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SGCBQ16585 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SGCBQ16585 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SGCBQ16585 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SGCBQ16585 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SGCBQ16585 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SGCBQ16585 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SGCBQ16585 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SGCBQ16585 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SGCBQ16585 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SGCBQ16585 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SGCBQ16585 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SGCBQ16585 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SGCBQ16585 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SGCBQ16585 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SGCBQ16585 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SGCBQ16585 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SGCBQ16585 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SGCBQ16585 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SGCBQ16585 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SGCBQ16585 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
SGCBQ16585 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SGCBQ16585 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SGCBQ16585 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SGCBQ16585 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SGCBQ16585 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SGCBQ16585 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SGCBQ16585 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SGCBQ16585 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SGCBQ16585 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SGCBQ16585 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SGCBQ16585 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SGCBQ16585 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SGCBQ16585 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SGCBQ16585 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
SGCBQ16585 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SGCBQ16585 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SGCBQ16585 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SGCBQ16585 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SGCBQ16585 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SGCBQ16585 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SGCBQ16585 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SGCBQ16585 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SGCBQ16585 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SGCBQ16585 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SGCBQ16585 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
SGCBQ16585 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SGCBQ16585 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SGCBQ16585 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SGCBQ16585 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SGCBQ16585 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SGCBQ16585 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SGCBQ16585 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SGCBQ16585 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SGCBQ16585 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SGCBQ16585 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SGCBQ16585 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SGCBQ16585 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SGCBQ16585 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SGCBQ16585 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SGCBQ16585 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SGCBQ16585 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
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