Protein–RNA interactions for Protein: Q15836

VAMP3, Vesicle-associated membrane protein 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAMP3Q15836 CCNI2-204ENST00000614847 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
VAMP3Q15836 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
VAMP3Q15836 SMC4-204ENST00000462787 5033 ntTSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
VAMP3Q15836 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
VAMP3Q15836 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
VAMP3Q15836 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
VAMP3Q15836 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
VAMP3Q15836 CRTC3-202ENST00000420329 5209 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
VAMP3Q15836 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
VAMP3Q15836 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
VAMP3Q15836 GPC1-201ENST00000264039 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
VAMP3Q15836 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
VAMP3Q15836 KDM5C-205ENST00000404049 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
VAMP3Q15836 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
VAMP3Q15836 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
VAMP3Q15836 KIF16B-203ENST00000408042 4640 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
VAMP3Q15836 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
VAMP3Q15836 THRA-203ENST00000450525 4895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
VAMP3Q15836 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
VAMP3Q15836 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
VAMP3Q15836 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
VAMP3Q15836 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC14.24□□□□□ -0.13
VAMP3Q15836 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
VAMP3Q15836 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
VAMP3Q15836 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC14.24□□□□□ -0.13
VAMP3Q15836 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC14.24□□□□□ -0.13
VAMP3Q15836 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
VAMP3Q15836 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
VAMP3Q15836 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
VAMP3Q15836 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
VAMP3Q15836 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
VAMP3Q15836 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
VAMP3Q15836 CEP104-202ENST00000378230 6424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
VAMP3Q15836 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
VAMP3Q15836 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
VAMP3Q15836 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
VAMP3Q15836 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
VAMP3Q15836 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
VAMP3Q15836 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
VAMP3Q15836 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
VAMP3Q15836 RALGAPA1-203ENST00000389698 7864 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
VAMP3Q15836 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
VAMP3Q15836 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
VAMP3Q15836 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
VAMP3Q15836 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
VAMP3Q15836 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
VAMP3Q15836 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC14.23□□□□□ -0.13
VAMP3Q15836 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC14.23□□□□□ -0.13
VAMP3Q15836 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
VAMP3Q15836 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
VAMP3Q15836 LCORL-203ENST00000382226 5009 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
VAMP3Q15836 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
VAMP3Q15836 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
VAMP3Q15836 SPOCK1-202ENST00000394945 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
VAMP3Q15836 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
VAMP3Q15836 KCNMA1-201ENST00000286627 6194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
VAMP3Q15836 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
VAMP3Q15836 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC14.23□□□□□ -0.13
VAMP3Q15836 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
VAMP3Q15836 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
VAMP3Q15836 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
VAMP3Q15836 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
VAMP3Q15836 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
VAMP3Q15836 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
VAMP3Q15836 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
VAMP3Q15836 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
VAMP3Q15836 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
VAMP3Q15836 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
VAMP3Q15836 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
VAMP3Q15836 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
VAMP3Q15836 CTNNB1-210ENST00000453024 2841 ntTSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
VAMP3Q15836 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
VAMP3Q15836 SLC9A2-201ENST00000233969 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
VAMP3Q15836 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC14.22□□□□□ -0.13
VAMP3Q15836 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
VAMP3Q15836 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
VAMP3Q15836 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
VAMP3Q15836 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
VAMP3Q15836 USP45-201ENST00000327681 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
VAMP3Q15836 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
VAMP3Q15836 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
VAMP3Q15836 SPOCK2-202ENST00000373109 5445 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
VAMP3Q15836 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
VAMP3Q15836 SRPK1-204ENST00000373825 4592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
VAMP3Q15836 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
VAMP3Q15836 CHD4-210ENST00000544040 6514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
VAMP3Q15836 COL17A1-202ENST00000369733 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
VAMP3Q15836 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
VAMP3Q15836 NTRK2-205ENST00000376208 8178 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
VAMP3Q15836 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
VAMP3Q15836 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
VAMP3Q15836 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
VAMP3Q15836 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
VAMP3Q15836 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
VAMP3Q15836 FLJ16779-201ENST00000612722 7638 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
VAMP3Q15836 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
VAMP3Q15836 SFXN1-201ENST00000321442 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
VAMP3Q15836 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
VAMP3Q15836 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
VAMP3Q15836 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC14.21□□□□□ -0.13
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