Protein–RNA interactions for Protein: Q15120

PDK3, [Pyruvate dehydrogenase (acetyl-transferring)] kinase isozyme 3, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 406 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDK3Q15120 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
PDK3Q15120 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
PDK3Q15120 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
PDK3Q15120 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
PDK3Q15120 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
PDK3Q15120 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
PDK3Q15120 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
PDK3Q15120 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
PDK3Q15120 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PDK3Q15120 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC19.01■□□□□ 0.63
PDK3Q15120 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
PDK3Q15120 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
PDK3Q15120 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
PDK3Q15120 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
PDK3Q15120 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
PDK3Q15120 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
PDK3Q15120 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
PDK3Q15120 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
PDK3Q15120 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
PDK3Q15120 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
PDK3Q15120 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
PDK3Q15120 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PDK3Q15120 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
PDK3Q15120 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PDK3Q15120 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
PDK3Q15120 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
PDK3Q15120 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
PDK3Q15120 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
PDK3Q15120 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
PDK3Q15120 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PDK3Q15120 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
PDK3Q15120 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
PDK3Q15120 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PDK3Q15120 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC19■□□□□ 0.63
PDK3Q15120 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PDK3Q15120 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PDK3Q15120 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
PDK3Q15120 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
PDK3Q15120 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
PDK3Q15120 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC19■□□□□ 0.63
PDK3Q15120 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
PDK3Q15120 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC19■□□□□ 0.63
PDK3Q15120 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PDK3Q15120 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PDK3Q15120 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
PDK3Q15120 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
PDK3Q15120 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PDK3Q15120 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PDK3Q15120 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
PDK3Q15120 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
PDK3Q15120 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PDK3Q15120 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PDK3Q15120 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
PDK3Q15120 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
PDK3Q15120 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PDK3Q15120 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
PDK3Q15120 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
PDK3Q15120 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PDK3Q15120 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PDK3Q15120 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
PDK3Q15120 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PDK3Q15120 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PDK3Q15120 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
PDK3Q15120 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PDK3Q15120 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PDK3Q15120 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
PDK3Q15120 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
PDK3Q15120 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PDK3Q15120 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
PDK3Q15120 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
PDK3Q15120 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PDK3Q15120 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
PDK3Q15120 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PDK3Q15120 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PDK3Q15120 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PDK3Q15120 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
PDK3Q15120 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
PDK3Q15120 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PDK3Q15120 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PDK3Q15120 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
PDK3Q15120 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PDK3Q15120 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
PDK3Q15120 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC18.98■□□□□ 0.63
PDK3Q15120 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PDK3Q15120 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PDK3Q15120 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
PDK3Q15120 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
PDK3Q15120 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
PDK3Q15120 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PDK3Q15120 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
PDK3Q15120 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PDK3Q15120 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PDK3Q15120 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PDK3Q15120 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PDK3Q15120 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
PDK3Q15120 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PDK3Q15120 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC18.97■□□□□ 0.63
PDK3Q15120 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
PDK3Q15120 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PDK3Q15120 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.97■□□□□ 0.63
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