Protein–RNA interactions for Protein: Q14676

MDC1, Mediator of DNA damage checkpoint protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,089 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MDC1Q14676 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
MDC1Q14676 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
MDC1Q14676 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
MDC1Q14676 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
MDC1Q14676 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
MDC1Q14676 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
MDC1Q14676 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
MDC1Q14676 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
MDC1Q14676 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
MDC1Q14676 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
MDC1Q14676 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
MDC1Q14676 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC19.02■□□□□ 0.64
MDC1Q14676 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
MDC1Q14676 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
MDC1Q14676 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
MDC1Q14676 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
MDC1Q14676 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
MDC1Q14676 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
MDC1Q14676 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
MDC1Q14676 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
MDC1Q14676 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
MDC1Q14676 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
MDC1Q14676 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
MDC1Q14676 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.63
MDC1Q14676 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC19.02■□□□□ 0.63
MDC1Q14676 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
MDC1Q14676 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
MDC1Q14676 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
MDC1Q14676 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
MDC1Q14676 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
MDC1Q14676 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.63
MDC1Q14676 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
MDC1Q14676 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
MDC1Q14676 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
MDC1Q14676 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
MDC1Q14676 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
MDC1Q14676 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
MDC1Q14676 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
MDC1Q14676 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
MDC1Q14676 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
MDC1Q14676 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
MDC1Q14676 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
MDC1Q14676 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
MDC1Q14676 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
MDC1Q14676 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
MDC1Q14676 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
MDC1Q14676 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
MDC1Q14676 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
MDC1Q14676 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
MDC1Q14676 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
MDC1Q14676 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
MDC1Q14676 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
MDC1Q14676 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
MDC1Q14676 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
MDC1Q14676 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
MDC1Q14676 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
MDC1Q14676 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
MDC1Q14676 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC19■□□□□ 0.63
MDC1Q14676 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
MDC1Q14676 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
MDC1Q14676 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
MDC1Q14676 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
MDC1Q14676 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
MDC1Q14676 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
MDC1Q14676 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
MDC1Q14676 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
MDC1Q14676 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC19■□□□□ 0.63
MDC1Q14676 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
MDC1Q14676 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
MDC1Q14676 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
MDC1Q14676 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
MDC1Q14676 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
MDC1Q14676 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
MDC1Q14676 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
MDC1Q14676 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC18.99■□□□□ 0.63
MDC1Q14676 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
MDC1Q14676 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC18.99■□□□□ 0.63
MDC1Q14676 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
MDC1Q14676 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
MDC1Q14676 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
MDC1Q14676 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
MDC1Q14676 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
MDC1Q14676 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
MDC1Q14676 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
MDC1Q14676 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
MDC1Q14676 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
MDC1Q14676 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
MDC1Q14676 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
MDC1Q14676 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
MDC1Q14676 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
MDC1Q14676 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
MDC1Q14676 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
MDC1Q14676 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
MDC1Q14676 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
MDC1Q14676 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
MDC1Q14676 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
MDC1Q14676 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
MDC1Q14676 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
MDC1Q14676 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
MDC1Q14676 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
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