Protein–RNA interactions for Protein: Q13885

TUBB2A, Tubulin beta-2A chain, humanhuman

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Length 445 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBB2AQ13885 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
TUBB2AQ13885 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
TUBB2AQ13885 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
TUBB2AQ13885 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
TUBB2AQ13885 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
TUBB2AQ13885 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
TUBB2AQ13885 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
TUBB2AQ13885 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
TUBB2AQ13885 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC21.18■□□□□ 0.98
TUBB2AQ13885 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
TUBB2AQ13885 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
TUBB2AQ13885 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
TUBB2AQ13885 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
TUBB2AQ13885 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
TUBB2AQ13885 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
TUBB2AQ13885 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
TUBB2AQ13885 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
TUBB2AQ13885 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
TUBB2AQ13885 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
TUBB2AQ13885 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
TUBB2AQ13885 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
TUBB2AQ13885 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
TUBB2AQ13885 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
TUBB2AQ13885 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
TUBB2AQ13885 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
TUBB2AQ13885 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
TUBB2AQ13885 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
TUBB2AQ13885 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
TUBB2AQ13885 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
TUBB2AQ13885 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
TUBB2AQ13885 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
TUBB2AQ13885 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
TUBB2AQ13885 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
TUBB2AQ13885 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
TUBB2AQ13885 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
TUBB2AQ13885 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
TUBB2AQ13885 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
TUBB2AQ13885 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
TUBB2AQ13885 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
TUBB2AQ13885 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
TUBB2AQ13885 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
TUBB2AQ13885 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
TUBB2AQ13885 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
TUBB2AQ13885 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
TUBB2AQ13885 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
TUBB2AQ13885 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
TUBB2AQ13885 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
TUBB2AQ13885 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
TUBB2AQ13885 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
TUBB2AQ13885 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
TUBB2AQ13885 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
TUBB2AQ13885 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
TUBB2AQ13885 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
TUBB2AQ13885 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
TUBB2AQ13885 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
TUBB2AQ13885 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
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TUBB2AQ13885 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
TUBB2AQ13885 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
TUBB2AQ13885 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
TUBB2AQ13885 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
TUBB2AQ13885 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
TUBB2AQ13885 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
TUBB2AQ13885 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
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TUBB2AQ13885 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
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TUBB2AQ13885 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
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TUBB2AQ13885 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
TUBB2AQ13885 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
TUBB2AQ13885 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
TUBB2AQ13885 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
TUBB2AQ13885 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
TUBB2AQ13885 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
TUBB2AQ13885 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
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TUBB2AQ13885 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
TUBB2AQ13885 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
TUBB2AQ13885 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
TUBB2AQ13885 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
TUBB2AQ13885 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
TUBB2AQ13885 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
TUBB2AQ13885 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
TUBB2AQ13885 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
TUBB2AQ13885 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
TUBB2AQ13885 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
TUBB2AQ13885 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
TUBB2AQ13885 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
TUBB2AQ13885 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.1 ms