Protein–RNA interactions for Protein: Q13601

KRR1, KRR1 small subunit processome component homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 381 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRR1Q13601 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
KRR1Q13601 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
KRR1Q13601 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
KRR1Q13601 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
KRR1Q13601 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
KRR1Q13601 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
KRR1Q13601 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
KRR1Q13601 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
KRR1Q13601 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
KRR1Q13601 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
KRR1Q13601 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
KRR1Q13601 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
KRR1Q13601 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
KRR1Q13601 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
KRR1Q13601 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
KRR1Q13601 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
KRR1Q13601 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
KRR1Q13601 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
KRR1Q13601 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
KRR1Q13601 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
KRR1Q13601 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
KRR1Q13601 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
KRR1Q13601 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
KRR1Q13601 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
KRR1Q13601 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
KRR1Q13601 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
KRR1Q13601 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
KRR1Q13601 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
KRR1Q13601 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
KRR1Q13601 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
KRR1Q13601 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
KRR1Q13601 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
KRR1Q13601 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
KRR1Q13601 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
KRR1Q13601 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
KRR1Q13601 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
KRR1Q13601 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
KRR1Q13601 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
KRR1Q13601 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
KRR1Q13601 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
KRR1Q13601 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
KRR1Q13601 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
KRR1Q13601 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
KRR1Q13601 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
KRR1Q13601 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
KRR1Q13601 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
KRR1Q13601 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
KRR1Q13601 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
KRR1Q13601 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
KRR1Q13601 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
KRR1Q13601 ADCY6-202ENST00000357869 5748 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
KRR1Q13601 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
KRR1Q13601 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
KRR1Q13601 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
KRR1Q13601 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
KRR1Q13601 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
KRR1Q13601 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
KRR1Q13601 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
KRR1Q13601 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
KRR1Q13601 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
KRR1Q13601 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
KRR1Q13601 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
KRR1Q13601 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
KRR1Q13601 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
KRR1Q13601 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
KRR1Q13601 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
KRR1Q13601 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
KRR1Q13601 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
KRR1Q13601 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
KRR1Q13601 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
KRR1Q13601 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
KRR1Q13601 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
KRR1Q13601 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
KRR1Q13601 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
KRR1Q13601 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
KRR1Q13601 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
KRR1Q13601 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
KRR1Q13601 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
KRR1Q13601 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
KRR1Q13601 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
KRR1Q13601 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
KRR1Q13601 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
KRR1Q13601 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
KRR1Q13601 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
KRR1Q13601 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
KRR1Q13601 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
KRR1Q13601 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
KRR1Q13601 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
KRR1Q13601 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
KRR1Q13601 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
KRR1Q13601 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
KRR1Q13601 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
KRR1Q13601 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
KRR1Q13601 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
KRR1Q13601 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
KRR1Q13601 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
KRR1Q13601 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
KRR1Q13601 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
KRR1Q13601 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
KRR1Q13601 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
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