Protein–RNA interactions for Protein: Q13296

SCGB2A2, Mammaglobin-A, humanhuman

Predictions only

Length 93 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCGB2A2Q13296 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SCGB2A2Q13296 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SCGB2A2Q13296 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SCGB2A2Q13296 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SCGB2A2Q13296 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SCGB2A2Q13296 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SCGB2A2Q13296 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SCGB2A2Q13296 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SCGB2A2Q13296 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SCGB2A2Q13296 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SCGB2A2Q13296 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
SCGB2A2Q13296 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SCGB2A2Q13296 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SCGB2A2Q13296 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SCGB2A2Q13296 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SCGB2A2Q13296 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SCGB2A2Q13296 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SCGB2A2Q13296 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SCGB2A2Q13296 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SCGB2A2Q13296 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SCGB2A2Q13296 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SCGB2A2Q13296 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SCGB2A2Q13296 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SCGB2A2Q13296 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SCGB2A2Q13296 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SCGB2A2Q13296 ASXL1-212ENST00000620121 5374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SCGB2A2Q13296 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
SCGB2A2Q13296 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SCGB2A2Q13296 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SCGB2A2Q13296 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SCGB2A2Q13296 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SCGB2A2Q13296 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SCGB2A2Q13296 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SCGB2A2Q13296 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SCGB2A2Q13296 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SCGB2A2Q13296 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SCGB2A2Q13296 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SCGB2A2Q13296 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SCGB2A2Q13296 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SCGB2A2Q13296 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SCGB2A2Q13296 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SCGB2A2Q13296 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SCGB2A2Q13296 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SCGB2A2Q13296 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SCGB2A2Q13296 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SCGB2A2Q13296 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SCGB2A2Q13296 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SCGB2A2Q13296 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SCGB2A2Q13296 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SCGB2A2Q13296 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SCGB2A2Q13296 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
SCGB2A2Q13296 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SCGB2A2Q13296 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SCGB2A2Q13296 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SCGB2A2Q13296 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SCGB2A2Q13296 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SCGB2A2Q13296 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SCGB2A2Q13296 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SCGB2A2Q13296 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SCGB2A2Q13296 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SCGB2A2Q13296 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SCGB2A2Q13296 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SCGB2A2Q13296 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SCGB2A2Q13296 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SCGB2A2Q13296 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SCGB2A2Q13296 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
SCGB2A2Q13296 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SCGB2A2Q13296 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SCGB2A2Q13296 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SCGB2A2Q13296 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SCGB2A2Q13296 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SCGB2A2Q13296 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SCGB2A2Q13296 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SCGB2A2Q13296 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
SCGB2A2Q13296 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SCGB2A2Q13296 NETO2-202ENST00000562435 7481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SCGB2A2Q13296 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SCGB2A2Q13296 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SCGB2A2Q13296 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SCGB2A2Q13296 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SCGB2A2Q13296 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SCGB2A2Q13296 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SCGB2A2Q13296 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SCGB2A2Q13296 SLC8A3-202ENST00000356921 5250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
SCGB2A2Q13296 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
SCGB2A2Q13296 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
SCGB2A2Q13296 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
SCGB2A2Q13296 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
SCGB2A2Q13296 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SCGB2A2Q13296 GPD2-201ENST00000310454 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SCGB2A2Q13296 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SCGB2A2Q13296 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SCGB2A2Q13296 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SCGB2A2Q13296 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SCGB2A2Q13296 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SCGB2A2Q13296 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SCGB2A2Q13296 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SCGB2A2Q13296 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SCGB2A2Q13296 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SCGB2A2Q13296 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.9 ms