Protein–RNA interactions for Protein: Q13283

G3BP1, Ras GTPase-activating protein-binding protein 1, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 466 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
G3BP1Q13283 PDIA3-201ENST00000300289 3727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.252e-9■■□□□ 12
G3BP1Q13283 GLUD1-202ENST00000465164 503 ntTSL 27.46□□□□□ -1.221e-8■■□□□ 12
G3BP1Q13283 SEPT9-214ENST00000586456 545 ntTSL 224.83■■□□□ 1.578e-10■■□□□ 12
G3BP1Q13283 RNF40-209ENST00000566703 808 ntTSL 318.52■□□□□ 0.564e-8■■□□□ 12
G3BP1Q13283 EIF4A2-201ENST00000323963 1919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.434e-8■■□□□ 12
G3BP1Q13283 EIF4A2-203ENST00000426808 1751 ntTSL 1 (best)8.53□□□□□ -1.044e-8■■□□□ 12
G3BP1Q13283 EIF4A2-207ENST00000443963 1729 ntTSL 1 (best)8.37□□□□□ -1.074e-8■■□□□ 12
G3BP1Q13283 EIF4A2-205ENST00000440191 1889 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.93□□□□□ -1.144e-8■■□□□ 12
G3BP1Q13283 EIF4A2-218ENST00000475653 909 ntTSL 27.47□□□□□ -1.214e-8■■□□□ 12
G3BP1Q13283 EIF4A2-204ENST00000429589 1005 ntTSL 57.44□□□□□ -1.224e-8■■□□□ 12
G3BP1Q13283 EIF4A2-202ENST00000425053 1977 ntTSL 56.82□□□□□ -1.324e-8■■□□□ 12
G3BP1Q13283 EIF4A2-217ENST00000475409 802 ntTSL 26.5□□□□□ -1.374e-8■■□□□ 12
G3BP1Q13283 EIF4A2-222ENST00000492144 993 ntTSL 26.48□□□□□ -1.374e-8■■□□□ 12
G3BP1Q13283 EIF4A2-226ENST00000497177 849 ntTSL 56.05□□□□□ -1.444e-8■■□□□ 12
G3BP1Q13283 EIF4A2-216ENST00000468362 1356 ntTSL 25.76□□□□□ -1.494e-8■■□□□ 12
G3BP1Q13283 EIF4A2-219ENST00000485101 5327 ntTSL 55.08□□□□□ -1.64e-8■■□□□ 12
G3BP1Q13283 EIF4A2-213ENST00000465792 734 ntTSL 23.94□□□□□ -1.784e-8■■□□□ 12
G3BP1Q13283 PSAT1-201ENST00000347159 1411 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.133e-7■■□□□ 12
G3BP1Q13283 PSAT1-202ENST00000376588 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.223e-7■■□□□ 12
G3BP1Q13283 GALK1-203ENST00000586733 465 ntTSL 222.1■■□□□ 1.132e-7■■□□□ 12
G3BP1Q13283 GALK1-207ENST00000589643 313 ntTSL 318.03■□□□□ 0.482e-7■■□□□ 12
G3BP1Q13283 YWHAE-208ENST00000571732 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.565e-7■■□□□ 12
G3BP1Q13283 YWHAE-201ENST00000264335 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.345e-7■■□□□ 12
G3BP1Q13283 YWHAE-212ENST00000575977 540 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.125e-7■■□□□ 12
G3BP1Q13283 YWHAE-210ENST00000573026 780 ntTSL 3 BASIC12.97□□□□□ -0.335e-7■■□□□ 12
G3BP1Q13283 YWHAE-211ENST00000573196 739 ntTSL 212.97□□□□□ -0.335e-7■■□□□ 12
G3BP1Q13283 YWHAE-202ENST00000466227 1377 ntTSL 511.81□□□□□ -0.525e-7■■□□□ 12
G3BP1Q13283 YWHAE-206ENST00000496706 732 ntTSL 35.5□□□□□ -1.535e-7■■□□□ 12
G3BP1Q13283 PFKL-205ENST00000466134 5986 ntTSL 224.52■■□□□ 1.521e-6■■□□□ 12
G3BP1Q13283 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.981e-6■■□□□ 12
G3BP1Q13283 PFKL-202ENST00000397961 3390 ntTSL 1 (best)17.9■□□□□ 0.461e-6■■□□□ 12
G3BP1Q13283 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.491e-6■■□□□ 12
G3BP1Q13283 KHDRBS1-203ENST00000484270 1989 ntTSL 523.72■■□□□ 1.391e-6■■□□□ 12
G3BP1Q13283 KHDRBS1-201ENST00000307714 2738 ntTSL 1 (best)23.02■■□□□ 1.281e-6■■□□□ 12
G3BP1Q13283 KHDRBS1-202ENST00000327300 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.411e-6■■□□□ 12
G3BP1Q13283 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.865e-7■■□□□ 12
G3BP1Q13283 MBNL3-203ENST00000370849 1444 ntTSL 2 BASIC9.07□□□□□ -0.965e-7■■□□□ 12
G3BP1Q13283 MBNL3-206ENST00000394311 11263 ntTSL 2 BASIC7.97□□□□□ -1.135e-7■■□□□ 12
G3BP1Q13283 MBNL3-208ENST00000436215 891 ntTSL 36.78□□□□□ -1.325e-7■■□□□ 12
G3BP1Q13283 MBNL3-201ENST00000370839 1575 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.575e-7■■□□□ 12
G3BP1Q13283 MBNL3-204ENST00000370853 2661 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.07□□□□□ -1.765e-7■■□□□ 12
G3BP1Q13283 MBNL3-205ENST00000370857 8760 ntTSL 5 BASIC3.32□□□□□ -1.885e-7■■□□□ 12
G3BP1Q13283 MBNL3-212ENST00000538204 11294 ntTSL 1 (best) BASIC1.99□□□□□ -2.095e-7■■□□□ 12
G3BP1Q13283 CNP-201ENST00000393888 2583 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.672e-7■■□□□ 12
G3BP1Q13283 CNP-202ENST00000393892 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.212e-7■■□□□ 12
G3BP1Q13283 MDH1-205ENST00000432309 844 ntTSL 511.22□□□□□ -0.613e-7■■□□□ 12
G3BP1Q13283 MDH1-206ENST00000436321 680 ntTSL 38.87□□□□□ -0.993e-7■■□□□ 12
G3BP1Q13283 MDH1-204ENST00000421012 573 ntTSL 42.37□□□□□ -2.033e-7■■□□□ 12
G3BP1Q13283 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC32.11■■■□□ 2.737e-7■■□□□ 12
G3BP1Q13283 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.537e-7■■□□□ 12
G3BP1Q13283 CALM3-203ENST00000477244 696 ntTSL 314.23□□□□□ -0.137e-7■■□□□ 12
G3BP1Q13283 CALM3-210ENST00000597868 927 ntTSL 313.28□□□□□ -0.287e-7■■□□□ 12
G3BP1Q13283 CALM3-204ENST00000482455 650 ntTSL 49.61□□□□□ -0.877e-7■■□□□ 12
G3BP1Q13283 MKI67-202ENST00000368654 12678 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.622e-6■■□□□ 12
G3BP1Q13283 MKI67-201ENST00000368653 11417 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.11□□□□□ -1.272e-6■■□□□ 12
G3BP1Q13283 PMPCA-204ENST00000444897 2316 ntTSL 219.37■□□□□ 0.695e-8■■□□□ 11.9
G3BP1Q13283 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC38.34■■■■□ 3.735e-6■■□□□ 11.9
G3BP1Q13283 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.23■■■■□ 3.555e-6■■□□□ 11.9
G3BP1Q13283 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.925e-6■■□□□ 11.9
G3BP1Q13283 FAH-208ENST00000558767 2087 ntTSL 226.04■■□□□ 1.765e-6■■□□□ 11.9
G3BP1Q13283 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.612e-8■■□□□ 11.9
G3BP1Q13283 FAH-203ENST00000537726 1396 ntTSL 224.92■■□□□ 1.585e-6■■□□□ 11.9
G3BP1Q13283 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC24.86■■□□□ 1.575e-6■■□□□ 11.9
G3BP1Q13283 HMOX1-202ENST00000412893 921 ntTSL 324.73■■□□□ 1.555e-6■■□□□ 11.9
G3BP1Q13283 CHD4-213ENST00000545584 553 ntTSL 424.59■■□□□ 1.536e-7■■□□□ 11.9
G3BP1Q13283 BPTF-208ENST00000544778 7573 ntTSL 524.34■■□□□ 1.495e-6■■□□□ 11.9
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G3BP1Q13283 AC073896.1-203ENST00000548360 512 ntTSL 424.04■■□□□ 1.442e-8■■□□□ 11.9
G3BP1Q13283 CNPY2-207ENST00000551276 556 ntTSL 524.04■■□□□ 1.442e-8■■□□□ 11.9
G3BP1Q13283 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.225e-6■■□□□ 11.9
G3BP1Q13283 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.172e-8■■□□□ 11.9
G3BP1Q13283 LETM1-202ENST00000466175 1626 ntTSL 222.3■■□□□ 1.165e-6■■□□□ 11.9
G3BP1Q13283 CNPY2-206ENST00000548013 817 ntTSL 1 (best)22.16■■□□□ 1.142e-8■■□□□ 11.9
G3BP1Q13283 AC073896.1-202ENST00000547423 566 ntTSL 422.1■■□□□ 1.132e-8■■□□□ 11.9
G3BP1Q13283 SSB-206ENST00000461708 619 ntTSL 222.05■■□□□ 1.125e-6■■□□□ 11.9
G3BP1Q13283 HMOX1-203ENST00000481190 582 ntTSL 321.98■■□□□ 1.115e-6■■□□□ 11.9
G3BP1Q13283 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.091e-6■■□□□ 11.9
G3BP1Q13283 NT5DC2-215ENST00000492555 2004 ntTSL 1 (best)21.77■■□□□ 1.075e-6■■□□□ 11.9
G3BP1Q13283 NMT1-211ENST00000591931 748 ntTSL 221.47■■□□□ 1.035e-6■■□□□ 11.9
G3BP1Q13283 CNPY2-208ENST00000551286 484 ntTSL 521■□□□□ 0.952e-8■■□□□ 11.9
G3BP1Q13283 CNPY2-211ENST00000553164 666 ntTSL 520.51■□□□□ 0.872e-8■■□□□ 11.9
G3BP1Q13283 GLYR1-208ENST00000588297 580 ntTSL 320.42■□□□□ 0.865e-6■■□□□ 11.9
G3BP1Q13283 STAT1-207ENST00000424722 736 ntTSL 320.4■□□□□ 0.865e-6■■□□□ 11.9
G3BP1Q13283 CNPY2-202ENST00000546388 670 ntTSL 1 (best)20.29■□□□□ 0.842e-8■■□□□ 11.9
G3BP1Q13283 NT5DC2-213ENST00000489316 772 ntTSL 519.66■□□□□ 0.745e-6■■□□□ 11.9
G3BP1Q13283 FAH-212ENST00000561369 746 ntTSL 319.55■□□□□ 0.725e-6■■□□□ 11.9
G3BP1Q13283 STAT1-210ENST00000454414 572 ntTSL 419.06■□□□□ 0.645e-6■■□□□ 11.9
G3BP1Q13283 NMT1-205ENST00000587120 573 ntTSL 518.9■□□□□ 0.625e-6■■□□□ 11.9
G3BP1Q13283 BPTF-202ENST00000321892 11292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.495e-6■■□□□ 11.9
G3BP1Q13283 TRIM25-201ENST00000316881 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.45e-11■■□□□ 11.9
G3BP1Q13283 FXR1-209ENST00000472339 2130 ntTSL 517.53■□□□□ 0.45e-6■■□□□ 11.9
G3BP1Q13283 SSB-204ENST00000417292 545 ntTSL 316.82■□□□□ 0.285e-6■■□□□ 11.9
G3BP1Q13283 FXR1-214ENST00000480918 1996 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.275e-6■■□□□ 11.9
G3BP1Q13283 SSB-203ENST00000413002 674 ntTSL 316.3■□□□□ 0.25e-6■■□□□ 11.9
G3BP1Q13283 MCM3AP-204ENST00000467026 2671 ntTSL 1 (best)16.29■□□□□ 0.25e-6■■□□□ 11.9
G3BP1Q13283 GLYR1-212ENST00000591451 1831 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.175e-6■■□□□ 11.9
G3BP1Q13283 NT5DC2-212ENST00000487779 536 ntTSL 315.77■□□□□ 0.125e-6■■□□□ 11.9
G3BP1Q13283 TRIM25-202ENST00000537230 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.085e-11■■□□□ 11.9
G3BP1Q13283 NT5DC2-201ENST00000307076 2047 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -05e-6■■□□□ 11.9
G3BP1Q13283 PSMD4-202ENST00000368884 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.011e-6■■□□□ 11.9
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