Protein–RNA interactions for Protein: Q13214

SEMA3B, Semaphorin-3B, humanhuman

Predictions only

Length 749 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA3BQ13214 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
SEMA3BQ13214 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
SEMA3BQ13214 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC20.63■□□□□ 0.89
SEMA3BQ13214 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
SEMA3BQ13214 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
SEMA3BQ13214 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
SEMA3BQ13214 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
SEMA3BQ13214 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC20.63■□□□□ 0.89
SEMA3BQ13214 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
SEMA3BQ13214 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
SEMA3BQ13214 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC20.63■□□□□ 0.89
SEMA3BQ13214 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SEMA3BQ13214 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
SEMA3BQ13214 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SEMA3BQ13214 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC20.62■□□□□ 0.89
SEMA3BQ13214 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
SEMA3BQ13214 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
SEMA3BQ13214 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
SEMA3BQ13214 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
SEMA3BQ13214 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SEMA3BQ13214 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SEMA3BQ13214 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
SEMA3BQ13214 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
SEMA3BQ13214 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
SEMA3BQ13214 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SEMA3BQ13214 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SEMA3BQ13214 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SEMA3BQ13214 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
SEMA3BQ13214 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SEMA3BQ13214 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SEMA3BQ13214 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SEMA3BQ13214 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SEMA3BQ13214 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SEMA3BQ13214 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SEMA3BQ13214 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SEMA3BQ13214 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
SEMA3BQ13214 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
SEMA3BQ13214 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SEMA3BQ13214 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SEMA3BQ13214 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
SEMA3BQ13214 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
SEMA3BQ13214 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SEMA3BQ13214 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SEMA3BQ13214 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
SEMA3BQ13214 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
SEMA3BQ13214 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
SEMA3BQ13214 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SEMA3BQ13214 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SEMA3BQ13214 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SEMA3BQ13214 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
SEMA3BQ13214 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
SEMA3BQ13214 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
SEMA3BQ13214 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
SEMA3BQ13214 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
SEMA3BQ13214 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC20.61■□□□□ 0.89
SEMA3BQ13214 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
SEMA3BQ13214 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SEMA3BQ13214 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
SEMA3BQ13214 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SEMA3BQ13214 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
SEMA3BQ13214 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SEMA3BQ13214 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SEMA3BQ13214 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SEMA3BQ13214 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SEMA3BQ13214 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SEMA3BQ13214 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SEMA3BQ13214 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SEMA3BQ13214 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SEMA3BQ13214 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SEMA3BQ13214 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SEMA3BQ13214 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SEMA3BQ13214 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SEMA3BQ13214 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SEMA3BQ13214 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SEMA3BQ13214 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SEMA3BQ13214 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SEMA3BQ13214 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SEMA3BQ13214 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SEMA3BQ13214 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
SEMA3BQ13214 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SEMA3BQ13214 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SEMA3BQ13214 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SEMA3BQ13214 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SEMA3BQ13214 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SEMA3BQ13214 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SEMA3BQ13214 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SEMA3BQ13214 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SEMA3BQ13214 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SEMA3BQ13214 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SEMA3BQ13214 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SEMA3BQ13214 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SEMA3BQ13214 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SEMA3BQ13214 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SEMA3BQ13214 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SEMA3BQ13214 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SEMA3BQ13214 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
SEMA3BQ13214 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
SEMA3BQ13214 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
SEMA3BQ13214 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SEMA3BQ13214 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
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