Protein–RNA interactions for Protein: Q12824

SMARCB1, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily B member 1, humanhuman

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Length 385 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCB1Q12824 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
SMARCB1Q12824 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
SMARCB1Q12824 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
SMARCB1Q12824 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
SMARCB1Q12824 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
SMARCB1Q12824 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
SMARCB1Q12824 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
SMARCB1Q12824 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
SMARCB1Q12824 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
SMARCB1Q12824 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
SMARCB1Q12824 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
SMARCB1Q12824 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
SMARCB1Q12824 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC20.97■□□□□ 0.95
SMARCB1Q12824 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
SMARCB1Q12824 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC20.97■□□□□ 0.95
SMARCB1Q12824 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC20.97■□□□□ 0.95
SMARCB1Q12824 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
SMARCB1Q12824 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
SMARCB1Q12824 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
SMARCB1Q12824 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
SMARCB1Q12824 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
SMARCB1Q12824 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
SMARCB1Q12824 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
SMARCB1Q12824 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
SMARCB1Q12824 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
SMARCB1Q12824 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
SMARCB1Q12824 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
SMARCB1Q12824 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
SMARCB1Q12824 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
SMARCB1Q12824 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
SMARCB1Q12824 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
SMARCB1Q12824 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
SMARCB1Q12824 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC20.96■□□□□ 0.95
SMARCB1Q12824 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
SMARCB1Q12824 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC20.96■□□□□ 0.95
SMARCB1Q12824 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.96■□□□□ 0.95
SMARCB1Q12824 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC20.96■□□□□ 0.95
SMARCB1Q12824 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC20.96■□□□□ 0.95
SMARCB1Q12824 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
SMARCB1Q12824 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
SMARCB1Q12824 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
SMARCB1Q12824 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
SMARCB1Q12824 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
SMARCB1Q12824 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
SMARCB1Q12824 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC20.95■□□□□ 0.95
SMARCB1Q12824 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
SMARCB1Q12824 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
SMARCB1Q12824 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
SMARCB1Q12824 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
SMARCB1Q12824 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
SMARCB1Q12824 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
SMARCB1Q12824 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
SMARCB1Q12824 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
SMARCB1Q12824 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
SMARCB1Q12824 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
SMARCB1Q12824 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
SMARCB1Q12824 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
SMARCB1Q12824 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
SMARCB1Q12824 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
SMARCB1Q12824 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
SMARCB1Q12824 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.94
SMARCB1Q12824 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.94
SMARCB1Q12824 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
SMARCB1Q12824 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
SMARCB1Q12824 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
SMARCB1Q12824 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
SMARCB1Q12824 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
SMARCB1Q12824 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
SMARCB1Q12824 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
SMARCB1Q12824 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
SMARCB1Q12824 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
SMARCB1Q12824 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
SMARCB1Q12824 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
SMARCB1Q12824 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
SMARCB1Q12824 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
SMARCB1Q12824 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC20.94■□□□□ 0.94
SMARCB1Q12824 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
SMARCB1Q12824 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
SMARCB1Q12824 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
SMARCB1Q12824 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
SMARCB1Q12824 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
SMARCB1Q12824 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
SMARCB1Q12824 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
SMARCB1Q12824 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
SMARCB1Q12824 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
SMARCB1Q12824 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
SMARCB1Q12824 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
SMARCB1Q12824 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
SMARCB1Q12824 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
SMARCB1Q12824 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
SMARCB1Q12824 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SMARCB1Q12824 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SMARCB1Q12824 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC20.93■□□□□ 0.94
SMARCB1Q12824 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SMARCB1Q12824 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SMARCB1Q12824 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
SMARCB1Q12824 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
SMARCB1Q12824 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SMARCB1Q12824 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SMARCB1Q12824 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
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