Protein–RNA interactions for Protein: Q08722

CD47, Leukocyte surface antigen CD47, humanhuman

Predictions only

Length 323 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD47Q08722 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CD47Q08722 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CD47Q08722 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CD47Q08722 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CD47Q08722 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CD47Q08722 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CD47Q08722 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CD47Q08722 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
CD47Q08722 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CD47Q08722 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CD47Q08722 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CD47Q08722 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CD47Q08722 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CD47Q08722 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CD47Q08722 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CD47Q08722 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CD47Q08722 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CD47Q08722 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CD47Q08722 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CD47Q08722 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CD47Q08722 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CD47Q08722 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CD47Q08722 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CD47Q08722 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CD47Q08722 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CD47Q08722 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CD47Q08722 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CD47Q08722 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CD47Q08722 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CD47Q08722 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CD47Q08722 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CD47Q08722 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CD47Q08722 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
CD47Q08722 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CD47Q08722 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CD47Q08722 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CD47Q08722 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CD47Q08722 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
CD47Q08722 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CD47Q08722 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CD47Q08722 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CD47Q08722 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CD47Q08722 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CD47Q08722 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CD47Q08722 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
CD47Q08722 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CD47Q08722 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CD47Q08722 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CD47Q08722 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CD47Q08722 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CD47Q08722 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CD47Q08722 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CD47Q08722 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
CD47Q08722 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CD47Q08722 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CD47Q08722 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CD47Q08722 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
CD47Q08722 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CD47Q08722 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CD47Q08722 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CD47Q08722 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CD47Q08722 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CD47Q08722 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CD47Q08722 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CD47Q08722 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CD47Q08722 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CD47Q08722 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CD47Q08722 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CD47Q08722 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CD47Q08722 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CD47Q08722 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CD47Q08722 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CD47Q08722 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CD47Q08722 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CD47Q08722 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CD47Q08722 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CD47Q08722 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CD47Q08722 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
CD47Q08722 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CD47Q08722 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CD47Q08722 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CD47Q08722 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CD47Q08722 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CD47Q08722 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CD47Q08722 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CD47Q08722 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CD47Q08722 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CD47Q08722 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CD47Q08722 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CD47Q08722 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CD47Q08722 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CD47Q08722 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CD47Q08722 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CD47Q08722 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CD47Q08722 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CD47Q08722 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CD47Q08722 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CD47Q08722 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CD47Q08722 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CD47Q08722 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.9 ms