Protein–RNA interactions for Protein: Q02928

CYP4A11, Cytochrome P450 4A11, humanhuman

Predictions only

Length 519 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYP4A11Q02928 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CYP4A11Q02928 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CYP4A11Q02928 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CYP4A11Q02928 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CYP4A11Q02928 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CYP4A11Q02928 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CYP4A11Q02928 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CYP4A11Q02928 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CYP4A11Q02928 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CYP4A11Q02928 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
CYP4A11Q02928 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CYP4A11Q02928 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CYP4A11Q02928 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CYP4A11Q02928 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CYP4A11Q02928 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
CYP4A11Q02928 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CYP4A11Q02928 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
CYP4A11Q02928 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CYP4A11Q02928 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CYP4A11Q02928 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
CYP4A11Q02928 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CYP4A11Q02928 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CYP4A11Q02928 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
CYP4A11Q02928 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CYP4A11Q02928 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CYP4A11Q02928 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CYP4A11Q02928 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
CYP4A11Q02928 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CYP4A11Q02928 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CYP4A11Q02928 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CYP4A11Q02928 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CYP4A11Q02928 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CYP4A11Q02928 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CYP4A11Q02928 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
CYP4A11Q02928 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CYP4A11Q02928 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CYP4A11Q02928 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CYP4A11Q02928 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CYP4A11Q02928 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CYP4A11Q02928 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CYP4A11Q02928 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CYP4A11Q02928 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CYP4A11Q02928 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CYP4A11Q02928 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CYP4A11Q02928 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CYP4A11Q02928 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CYP4A11Q02928 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CYP4A11Q02928 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CYP4A11Q02928 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CYP4A11Q02928 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CYP4A11Q02928 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CYP4A11Q02928 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CYP4A11Q02928 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CYP4A11Q02928 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CYP4A11Q02928 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CYP4A11Q02928 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CYP4A11Q02928 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CYP4A11Q02928 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
CYP4A11Q02928 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CYP4A11Q02928 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CYP4A11Q02928 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
CYP4A11Q02928 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CYP4A11Q02928 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
CYP4A11Q02928 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
CYP4A11Q02928 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CYP4A11Q02928 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CYP4A11Q02928 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CYP4A11Q02928 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CYP4A11Q02928 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CYP4A11Q02928 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CYP4A11Q02928 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CYP4A11Q02928 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CYP4A11Q02928 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CYP4A11Q02928 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CYP4A11Q02928 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CYP4A11Q02928 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CYP4A11Q02928 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CYP4A11Q02928 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CYP4A11Q02928 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CYP4A11Q02928 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CYP4A11Q02928 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CYP4A11Q02928 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CYP4A11Q02928 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CYP4A11Q02928 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CYP4A11Q02928 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CYP4A11Q02928 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CYP4A11Q02928 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
CYP4A11Q02928 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CYP4A11Q02928 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CYP4A11Q02928 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CYP4A11Q02928 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CYP4A11Q02928 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CYP4A11Q02928 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CYP4A11Q02928 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CYP4A11Q02928 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
CYP4A11Q02928 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CYP4A11Q02928 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CYP4A11Q02928 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CYP4A11Q02928 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CYP4A11Q02928 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.2 ms