Protein–RNA interactions for Protein: Q02297

NRG1, Pro-neuregulin-1, membrane-bound isoform, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 640 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NRG1Q02297 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
NRG1Q02297 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
NRG1Q02297 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
NRG1Q02297 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
NRG1Q02297 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
NRG1Q02297 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
NRG1Q02297 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
NRG1Q02297 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
NRG1Q02297 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
NRG1Q02297 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
NRG1Q02297 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
NRG1Q02297 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
NRG1Q02297 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
NRG1Q02297 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.5■□□□□ 0.87
NRG1Q02297 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
NRG1Q02297 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
NRG1Q02297 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
NRG1Q02297 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
NRG1Q02297 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
NRG1Q02297 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
NRG1Q02297 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
NRG1Q02297 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
NRG1Q02297 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
NRG1Q02297 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
NRG1Q02297 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
NRG1Q02297 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
NRG1Q02297 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
NRG1Q02297 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
NRG1Q02297 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
NRG1Q02297 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
NRG1Q02297 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
NRG1Q02297 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
NRG1Q02297 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
NRG1Q02297 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
NRG1Q02297 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
NRG1Q02297 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
NRG1Q02297 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
NRG1Q02297 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
NRG1Q02297 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
NRG1Q02297 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
NRG1Q02297 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
NRG1Q02297 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
NRG1Q02297 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
NRG1Q02297 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
NRG1Q02297 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
NRG1Q02297 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
NRG1Q02297 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
NRG1Q02297 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
NRG1Q02297 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
NRG1Q02297 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
NRG1Q02297 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
NRG1Q02297 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
NRG1Q02297 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
NRG1Q02297 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
NRG1Q02297 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
NRG1Q02297 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
NRG1Q02297 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
NRG1Q02297 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
NRG1Q02297 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
NRG1Q02297 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
NRG1Q02297 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
NRG1Q02297 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
NRG1Q02297 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
NRG1Q02297 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
NRG1Q02297 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
NRG1Q02297 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
NRG1Q02297 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
NRG1Q02297 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
NRG1Q02297 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
NRG1Q02297 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
NRG1Q02297 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
NRG1Q02297 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
NRG1Q02297 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
NRG1Q02297 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
NRG1Q02297 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC20.47■□□□□ 0.87
NRG1Q02297 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
NRG1Q02297 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
NRG1Q02297 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
NRG1Q02297 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
NRG1Q02297 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
NRG1Q02297 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
NRG1Q02297 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
NRG1Q02297 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
NRG1Q02297 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
NRG1Q02297 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
NRG1Q02297 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
NRG1Q02297 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
NRG1Q02297 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
NRG1Q02297 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
NRG1Q02297 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
NRG1Q02297 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
NRG1Q02297 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
NRG1Q02297 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
NRG1Q02297 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
NRG1Q02297 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
NRG1Q02297 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
NRG1Q02297 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
NRG1Q02297 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
NRG1Q02297 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
NRG1Q02297 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.4 ms