Protein–RNA interactions for Protein: Q02224

CENPE, Centromere-associated protein E, humanhuman

Predictions only

Length 2,701 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPEQ02224 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CENPEQ02224 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
CENPEQ02224 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CENPEQ02224 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
CENPEQ02224 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CENPEQ02224 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CENPEQ02224 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CENPEQ02224 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CENPEQ02224 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CENPEQ02224 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CENPEQ02224 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CENPEQ02224 NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 568 ntTSL 4 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CENPEQ02224 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CENPEQ02224 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
CENPEQ02224 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CENPEQ02224 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CENPEQ02224 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CENPEQ02224 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
CENPEQ02224 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CENPEQ02224 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CENPEQ02224 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CENPEQ02224 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CENPEQ02224 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CENPEQ02224 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CENPEQ02224 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CENPEQ02224 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CENPEQ02224 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CENPEQ02224 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CENPEQ02224 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CENPEQ02224 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CENPEQ02224 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CENPEQ02224 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CENPEQ02224 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CENPEQ02224 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CENPEQ02224 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CENPEQ02224 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CENPEQ02224 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CENPEQ02224 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CENPEQ02224 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CENPEQ02224 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CENPEQ02224 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CENPEQ02224 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CENPEQ02224 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CENPEQ02224 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CENPEQ02224 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CENPEQ02224 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CENPEQ02224 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CENPEQ02224 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CENPEQ02224 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CENPEQ02224 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CENPEQ02224 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CENPEQ02224 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CENPEQ02224 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CENPEQ02224 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CENPEQ02224 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CENPEQ02224 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CENPEQ02224 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CENPEQ02224 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CENPEQ02224 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CENPEQ02224 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CENPEQ02224 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CENPEQ02224 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CENPEQ02224 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CENPEQ02224 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CENPEQ02224 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CENPEQ02224 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CENPEQ02224 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CENPEQ02224 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CENPEQ02224 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
CENPEQ02224 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CENPEQ02224 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CENPEQ02224 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CENPEQ02224 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CENPEQ02224 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CENPEQ02224 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CENPEQ02224 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CENPEQ02224 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CENPEQ02224 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CENPEQ02224 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
CENPEQ02224 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
CENPEQ02224 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CENPEQ02224 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CENPEQ02224 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CENPEQ02224 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CENPEQ02224 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CENPEQ02224 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CENPEQ02224 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
CENPEQ02224 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CENPEQ02224 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
CENPEQ02224 AC243965.1-201ENST00000557595 781 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CENPEQ02224 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CENPEQ02224 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CENPEQ02224 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CENPEQ02224 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CENPEQ02224 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CENPEQ02224 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
CENPEQ02224 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CENPEQ02224 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CENPEQ02224 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CENPEQ02224 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.5 ms