Protein–RNA interactions for Protein: Q00610

CLTC, Clathrin heavy chain 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,675 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLTCQ00610 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
CLTCQ00610 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
CLTCQ00610 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
CLTCQ00610 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
CLTCQ00610 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC29.21■■■□□ 2.27
CLTCQ00610 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
CLTCQ00610 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC29.2■■■□□ 2.27
CLTCQ00610 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
CLTCQ00610 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
CLTCQ00610 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
CLTCQ00610 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.26
CLTCQ00610 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.26
CLTCQ00610 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.26
CLTCQ00610 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
CLTCQ00610 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
CLTCQ00610 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.26
CLTCQ00610 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.26
CLTCQ00610 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC29.2■■■□□ 2.26
CLTCQ00610 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
CLTCQ00610 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
CLTCQ00610 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
CLTCQ00610 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
CLTCQ00610 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
CLTCQ00610 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
CLTCQ00610 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
CLTCQ00610 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
CLTCQ00610 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
CLTCQ00610 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
CLTCQ00610 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
CLTCQ00610 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
CLTCQ00610 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC29.18■■■□□ 2.26
CLTCQ00610 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC29.18■■■□□ 2.26
CLTCQ00610 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC29.18■■■□□ 2.26
CLTCQ00610 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC29.18■■■□□ 2.26
CLTCQ00610 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC29.18■■■□□ 2.26
CLTCQ00610 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC29.18■■■□□ 2.26
CLTCQ00610 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
CLTCQ00610 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
CLTCQ00610 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
CLTCQ00610 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
CLTCQ00610 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
CLTCQ00610 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
CLTCQ00610 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
CLTCQ00610 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
CLTCQ00610 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC29.18■■■□□ 2.26
CLTCQ00610 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
CLTCQ00610 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
CLTCQ00610 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
CLTCQ00610 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
CLTCQ00610 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC29.17■■■□□ 2.26
CLTCQ00610 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
CLTCQ00610 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
CLTCQ00610 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC29.17■■■□□ 2.26
CLTCQ00610 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
CLTCQ00610 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC29.17■■■□□ 2.26
CLTCQ00610 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC29.17■■■□□ 2.26
CLTCQ00610 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
CLTCQ00610 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
CLTCQ00610 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
CLTCQ00610 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
CLTCQ00610 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
CLTCQ00610 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
CLTCQ00610 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
CLTCQ00610 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
CLTCQ00610 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
CLTCQ00610 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
CLTCQ00610 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
CLTCQ00610 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC29.16■■■□□ 2.26
CLTCQ00610 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
CLTCQ00610 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.16■■■□□ 2.26
CLTCQ00610 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
CLTCQ00610 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
CLTCQ00610 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
CLTCQ00610 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
CLTCQ00610 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
CLTCQ00610 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
CLTCQ00610 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
CLTCQ00610 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC29.15■■■□□ 2.26
CLTCQ00610 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC29.15■■■□□ 2.26
CLTCQ00610 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC29.15■■■□□ 2.26
CLTCQ00610 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
CLTCQ00610 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
CLTCQ00610 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
CLTCQ00610 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
CLTCQ00610 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
CLTCQ00610 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC29.15■■■□□ 2.26
CLTCQ00610 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
CLTCQ00610 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC29.15■■■□□ 2.26
CLTCQ00610 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
CLTCQ00610 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
CLTCQ00610 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.26
CLTCQ00610 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.26
CLTCQ00610 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC29.14■■■□□ 2.26
CLTCQ00610 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.26
CLTCQ00610 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.26
CLTCQ00610 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC29.14■■■□□ 2.26
CLTCQ00610 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC29.14■■■□□ 2.26
CLTCQ00610 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
CLTCQ00610 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC29.14■■■□□ 2.26
CLTCQ00610 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC29.14■■■□□ 2.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34 ms