Protein–RNA interactions for Protein: P98172

EFNB1, Ephrin-B1, humanhuman

Predictions only

Length 346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFNB1P98172 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
EFNB1P98172 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
EFNB1P98172 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
EFNB1P98172 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
EFNB1P98172 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
EFNB1P98172 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
EFNB1P98172 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
EFNB1P98172 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
EFNB1P98172 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
EFNB1P98172 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
EFNB1P98172 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
EFNB1P98172 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
EFNB1P98172 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
EFNB1P98172 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
EFNB1P98172 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
EFNB1P98172 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
EFNB1P98172 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
EFNB1P98172 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
EFNB1P98172 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
EFNB1P98172 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
EFNB1P98172 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
EFNB1P98172 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
EFNB1P98172 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
EFNB1P98172 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
EFNB1P98172 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
EFNB1P98172 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
EFNB1P98172 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
EFNB1P98172 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
EFNB1P98172 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
EFNB1P98172 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
EFNB1P98172 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
EFNB1P98172 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
EFNB1P98172 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
EFNB1P98172 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
EFNB1P98172 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
EFNB1P98172 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
EFNB1P98172 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
EFNB1P98172 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
EFNB1P98172 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
EFNB1P98172 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC17.83■□□□□ 0.45
EFNB1P98172 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
EFNB1P98172 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
EFNB1P98172 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
EFNB1P98172 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
EFNB1P98172 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
EFNB1P98172 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
EFNB1P98172 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
EFNB1P98172 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
EFNB1P98172 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
EFNB1P98172 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
EFNB1P98172 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
EFNB1P98172 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC17.83■□□□□ 0.44
EFNB1P98172 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
EFNB1P98172 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
EFNB1P98172 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
EFNB1P98172 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
EFNB1P98172 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
EFNB1P98172 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
EFNB1P98172 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
EFNB1P98172 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
EFNB1P98172 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
EFNB1P98172 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
EFNB1P98172 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
EFNB1P98172 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
EFNB1P98172 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
EFNB1P98172 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
EFNB1P98172 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
EFNB1P98172 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
EFNB1P98172 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
EFNB1P98172 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
EFNB1P98172 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
EFNB1P98172 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
EFNB1P98172 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
EFNB1P98172 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
EFNB1P98172 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
EFNB1P98172 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC17.82■□□□□ 0.44
EFNB1P98172 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
EFNB1P98172 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
EFNB1P98172 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
EFNB1P98172 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
EFNB1P98172 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
EFNB1P98172 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
EFNB1P98172 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
EFNB1P98172 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
EFNB1P98172 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
EFNB1P98172 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
EFNB1P98172 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
EFNB1P98172 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
EFNB1P98172 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
EFNB1P98172 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
EFNB1P98172 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
EFNB1P98172 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
EFNB1P98172 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
EFNB1P98172 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
EFNB1P98172 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
EFNB1P98172 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
EFNB1P98172 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
EFNB1P98172 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
EFNB1P98172 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
EFNB1P98172 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.5 ms