Protein–RNA interactions for Protein: P68371

TUBB4B, Tubulin beta-4B chain, humanhuman

Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBB4BP68371 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
TUBB4BP68371 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TUBB4BP68371 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TUBB4BP68371 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TUBB4BP68371 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
TUBB4BP68371 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TUBB4BP68371 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
TUBB4BP68371 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TUBB4BP68371 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
TUBB4BP68371 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
TUBB4BP68371 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TUBB4BP68371 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
TUBB4BP68371 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
TUBB4BP68371 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TUBB4BP68371 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TUBB4BP68371 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TUBB4BP68371 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TUBB4BP68371 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
TUBB4BP68371 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TUBB4BP68371 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TUBB4BP68371 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
TUBB4BP68371 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
TUBB4BP68371 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC21.1■□□□□ 0.97
TUBB4BP68371 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
TUBB4BP68371 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
TUBB4BP68371 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TUBB4BP68371 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TUBB4BP68371 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TUBB4BP68371 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TUBB4BP68371 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TUBB4BP68371 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
TUBB4BP68371 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TUBB4BP68371 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TUBB4BP68371 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
TUBB4BP68371 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TUBB4BP68371 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
TUBB4BP68371 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
TUBB4BP68371 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
TUBB4BP68371 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TUBB4BP68371 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
TUBB4BP68371 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
TUBB4BP68371 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TUBB4BP68371 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
TUBB4BP68371 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TUBB4BP68371 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
TUBB4BP68371 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
TUBB4BP68371 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
TUBB4BP68371 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
TUBB4BP68371 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
TUBB4BP68371 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
TUBB4BP68371 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
TUBB4BP68371 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
TUBB4BP68371 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
TUBB4BP68371 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
TUBB4BP68371 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
TUBB4BP68371 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
TUBB4BP68371 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
TUBB4BP68371 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
TUBB4BP68371 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
TUBB4BP68371 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
TUBB4BP68371 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
TUBB4BP68371 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
TUBB4BP68371 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
TUBB4BP68371 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
TUBB4BP68371 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC21.08■□□□□ 0.96
TUBB4BP68371 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
TUBB4BP68371 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
TUBB4BP68371 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
TUBB4BP68371 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
TUBB4BP68371 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
TUBB4BP68371 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
TUBB4BP68371 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
TUBB4BP68371 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
TUBB4BP68371 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
TUBB4BP68371 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
TUBB4BP68371 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
TUBB4BP68371 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
TUBB4BP68371 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
TUBB4BP68371 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
TUBB4BP68371 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
TUBB4BP68371 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
TUBB4BP68371 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
TUBB4BP68371 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
TUBB4BP68371 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC21.07■□□□□ 0.96
TUBB4BP68371 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
TUBB4BP68371 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
TUBB4BP68371 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
TUBB4BP68371 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
TUBB4BP68371 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC21.07■□□□□ 0.96
TUBB4BP68371 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
TUBB4BP68371 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
TUBB4BP68371 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
TUBB4BP68371 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
TUBB4BP68371 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
TUBB4BP68371 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
TUBB4BP68371 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
TUBB4BP68371 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
TUBB4BP68371 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
TUBB4BP68371 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
TUBB4BP68371 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.7 ms