Protein–RNA interactions for Protein: P63121

HERVK_113, Endogenous retrovirus group K member 113 Pro protein, humanhuman

Predictions only

Length 156 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERVK_113P63121 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
HERVK_113P63121 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC13.75□□□□□ -0.21
HERVK_113P63121 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
HERVK_113P63121 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
HERVK_113P63121 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
HERVK_113P63121 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
HERVK_113P63121 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
HERVK_113P63121 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
HERVK_113P63121 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC13.75□□□□□ -0.21
HERVK_113P63121 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
HERVK_113P63121 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
HERVK_113P63121 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
HERVK_113P63121 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
HERVK_113P63121 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
HERVK_113P63121 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
HERVK_113P63121 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
HERVK_113P63121 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
HERVK_113P63121 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
HERVK_113P63121 ASXL1-212ENST00000620121 5374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
HERVK_113P63121 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
HERVK_113P63121 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
HERVK_113P63121 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
HERVK_113P63121 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
HERVK_113P63121 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
HERVK_113P63121 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
HERVK_113P63121 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
HERVK_113P63121 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
HERVK_113P63121 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
HERVK_113P63121 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
HERVK_113P63121 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
HERVK_113P63121 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
HERVK_113P63121 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
HERVK_113P63121 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
HERVK_113P63121 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
HERVK_113P63121 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
HERVK_113P63121 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
HERVK_113P63121 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
HERVK_113P63121 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
HERVK_113P63121 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC13.74□□□□□ -0.21
HERVK_113P63121 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
HERVK_113P63121 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
HERVK_113P63121 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
HERVK_113P63121 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
HERVK_113P63121 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
HERVK_113P63121 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
HERVK_113P63121 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
HERVK_113P63121 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
HERVK_113P63121 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
HERVK_113P63121 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
HERVK_113P63121 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
HERVK_113P63121 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
HERVK_113P63121 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
HERVK_113P63121 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
HERVK_113P63121 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
HERVK_113P63121 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
HERVK_113P63121 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
HERVK_113P63121 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
HERVK_113P63121 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
HERVK_113P63121 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
HERVK_113P63121 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
HERVK_113P63121 CROCC2-201ENST00000443866 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
HERVK_113P63121 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
HERVK_113P63121 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
HERVK_113P63121 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
HERVK_113P63121 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
HERVK_113P63121 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
HERVK_113P63121 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
HERVK_113P63121 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
HERVK_113P63121 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
HERVK_113P63121 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
HERVK_113P63121 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
HERVK_113P63121 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
HERVK_113P63121 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
HERVK_113P63121 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
HERVK_113P63121 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
HERVK_113P63121 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
HERVK_113P63121 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
HERVK_113P63121 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
HERVK_113P63121 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
HERVK_113P63121 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
HERVK_113P63121 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
HERVK_113P63121 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
HERVK_113P63121 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
HERVK_113P63121 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
HERVK_113P63121 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
HERVK_113P63121 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
HERVK_113P63121 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
HERVK_113P63121 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
HERVK_113P63121 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
HERVK_113P63121 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
HERVK_113P63121 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
HERVK_113P63121 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
HERVK_113P63121 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
HERVK_113P63121 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
HERVK_113P63121 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
HERVK_113P63121 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
HERVK_113P63121 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
HERVK_113P63121 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
HERVK_113P63121 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
HERVK_113P63121 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.3 ms