Protein–RNA interactions for Protein: P60709

ACTB, Actin, cytoplasmic 1, humanhuman

Predictions only

Length 375 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTBP60709 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ACTBP60709 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ACTBP60709 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ACTBP60709 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ACTBP60709 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ACTBP60709 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ACTBP60709 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ACTBP60709 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ACTBP60709 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ACTBP60709 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ACTBP60709 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ACTBP60709 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ACTBP60709 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ACTBP60709 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ACTBP60709 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ACTBP60709 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ACTBP60709 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
ACTBP60709 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ACTBP60709 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ACTBP60709 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ACTBP60709 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ACTBP60709 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
ACTBP60709 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
ACTBP60709 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
ACTBP60709 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
ACTBP60709 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
ACTBP60709 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
ACTBP60709 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
ACTBP60709 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
ACTBP60709 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
ACTBP60709 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC17.08■□□□□ 0.33
ACTBP60709 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ACTBP60709 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ACTBP60709 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ACTBP60709 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ACTBP60709 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ACTBP60709 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ACTBP60709 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ACTBP60709 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ACTBP60709 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ACTBP60709 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ACTBP60709 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ACTBP60709 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ACTBP60709 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ACTBP60709 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ACTBP60709 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ACTBP60709 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ACTBP60709 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ACTBP60709 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ACTBP60709 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ACTBP60709 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ACTBP60709 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ACTBP60709 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ACTBP60709 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ACTBP60709 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ACTBP60709 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ACTBP60709 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
ACTBP60709 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ACTBP60709 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ACTBP60709 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ACTBP60709 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ACTBP60709 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ACTBP60709 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ACTBP60709 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ACTBP60709 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ACTBP60709 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ACTBP60709 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ACTBP60709 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ACTBP60709 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ACTBP60709 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ACTBP60709 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ACTBP60709 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ACTBP60709 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ACTBP60709 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ACTBP60709 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ACTBP60709 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ACTBP60709 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ACTBP60709 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ACTBP60709 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ACTBP60709 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
ACTBP60709 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ACTBP60709 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ACTBP60709 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ACTBP60709 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ACTBP60709 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ACTBP60709 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ACTBP60709 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ACTBP60709 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ACTBP60709 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
ACTBP60709 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
ACTBP60709 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ACTBP60709 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
ACTBP60709 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ACTBP60709 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ACTBP60709 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ACTBP60709 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
ACTBP60709 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ACTBP60709 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
ACTBP60709 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
ACTBP60709 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.9 ms