Protein–RNA interactions for Protein: P59942

MCCD1, Mitochondrial coiled-coil domain protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 119 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCCD1P59942 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
MCCD1P59942 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
MCCD1P59942 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC21.46■■□□□ 1.03
MCCD1P59942 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
MCCD1P59942 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
MCCD1P59942 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
MCCD1P59942 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
MCCD1P59942 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
MCCD1P59942 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
MCCD1P59942 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
MCCD1P59942 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
MCCD1P59942 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
MCCD1P59942 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
MCCD1P59942 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
MCCD1P59942 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
MCCD1P59942 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
MCCD1P59942 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
MCCD1P59942 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
MCCD1P59942 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
MCCD1P59942 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
MCCD1P59942 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
MCCD1P59942 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
MCCD1P59942 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
MCCD1P59942 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
MCCD1P59942 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
MCCD1P59942 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
MCCD1P59942 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
MCCD1P59942 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
MCCD1P59942 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
MCCD1P59942 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
MCCD1P59942 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
MCCD1P59942 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
MCCD1P59942 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
MCCD1P59942 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
MCCD1P59942 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
MCCD1P59942 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
MCCD1P59942 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
MCCD1P59942 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
MCCD1P59942 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
MCCD1P59942 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
MCCD1P59942 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
MCCD1P59942 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
MCCD1P59942 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
MCCD1P59942 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
MCCD1P59942 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
MCCD1P59942 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
MCCD1P59942 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
MCCD1P59942 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
MCCD1P59942 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
MCCD1P59942 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
MCCD1P59942 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
MCCD1P59942 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
MCCD1P59942 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
MCCD1P59942 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
MCCD1P59942 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
MCCD1P59942 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
MCCD1P59942 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
MCCD1P59942 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
MCCD1P59942 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
MCCD1P59942 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
MCCD1P59942 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
MCCD1P59942 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
MCCD1P59942 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
MCCD1P59942 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
MCCD1P59942 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
MCCD1P59942 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
MCCD1P59942 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
MCCD1P59942 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
MCCD1P59942 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
MCCD1P59942 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
MCCD1P59942 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
MCCD1P59942 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
MCCD1P59942 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
MCCD1P59942 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
MCCD1P59942 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
MCCD1P59942 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
MCCD1P59942 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
MCCD1P59942 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
MCCD1P59942 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
MCCD1P59942 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
MCCD1P59942 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC21.42■■□□□ 1.02
MCCD1P59942 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC21.42■■□□□ 1.02
MCCD1P59942 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
MCCD1P59942 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
MCCD1P59942 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
MCCD1P59942 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC21.42■■□□□ 1.02
MCCD1P59942 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
MCCD1P59942 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
MCCD1P59942 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
MCCD1P59942 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
MCCD1P59942 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
MCCD1P59942 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
MCCD1P59942 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
MCCD1P59942 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
MCCD1P59942 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
MCCD1P59942 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
MCCD1P59942 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
MCCD1P59942 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
MCCD1P59942 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
MCCD1P59942 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.1 ms