Protein–RNA interactions for Protein: P55895

RAG2, V(D)J recombination-activating protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 527 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAG2P55895 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
RAG2P55895 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
RAG2P55895 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
RAG2P55895 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
RAG2P55895 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
RAG2P55895 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
RAG2P55895 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
RAG2P55895 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
RAG2P55895 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
RAG2P55895 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
RAG2P55895 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
RAG2P55895 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
RAG2P55895 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
RAG2P55895 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
RAG2P55895 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
RAG2P55895 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
RAG2P55895 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
RAG2P55895 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
RAG2P55895 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
RAG2P55895 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
RAG2P55895 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
RAG2P55895 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
RAG2P55895 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
RAG2P55895 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
RAG2P55895 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
RAG2P55895 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
RAG2P55895 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
RAG2P55895 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
RAG2P55895 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
RAG2P55895 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC17.24■□□□□ 0.35
RAG2P55895 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
RAG2P55895 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
RAG2P55895 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
RAG2P55895 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
RAG2P55895 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
RAG2P55895 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
RAG2P55895 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
RAG2P55895 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
RAG2P55895 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
RAG2P55895 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
RAG2P55895 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
RAG2P55895 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
RAG2P55895 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
RAG2P55895 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
RAG2P55895 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
RAG2P55895 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
RAG2P55895 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
RAG2P55895 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
RAG2P55895 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
RAG2P55895 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
RAG2P55895 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
RAG2P55895 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
RAG2P55895 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
RAG2P55895 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
RAG2P55895 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
RAG2P55895 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
RAG2P55895 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
RAG2P55895 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
RAG2P55895 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
RAG2P55895 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
RAG2P55895 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
RAG2P55895 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
RAG2P55895 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
RAG2P55895 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
RAG2P55895 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
RAG2P55895 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
RAG2P55895 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
RAG2P55895 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
RAG2P55895 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
RAG2P55895 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
RAG2P55895 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
RAG2P55895 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
RAG2P55895 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
RAG2P55895 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
RAG2P55895 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
RAG2P55895 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
RAG2P55895 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
RAG2P55895 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
RAG2P55895 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
RAG2P55895 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
RAG2P55895 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
RAG2P55895 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
RAG2P55895 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
RAG2P55895 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
RAG2P55895 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
RAG2P55895 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
RAG2P55895 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
RAG2P55895 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
RAG2P55895 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
RAG2P55895 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
RAG2P55895 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
RAG2P55895 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
RAG2P55895 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
RAG2P55895 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
RAG2P55895 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
RAG2P55895 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
RAG2P55895 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
RAG2P55895 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
RAG2P55895 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
RAG2P55895 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.1 ms