Protein–RNA interactions for Protein: P55199

ELL, RNA polymerase II elongation factor ELL, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 621 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ELLP55199 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ELLP55199 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ELLP55199 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ELLP55199 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ELLP55199 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ELLP55199 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
ELLP55199 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ELLP55199 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ELLP55199 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ELLP55199 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ELLP55199 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ELLP55199 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ELLP55199 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ELLP55199 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ELLP55199 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ELLP55199 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ELLP55199 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ELLP55199 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ELLP55199 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ELLP55199 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ELLP55199 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ELLP55199 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ELLP55199 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ELLP55199 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ELLP55199 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ELLP55199 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ELLP55199 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ELLP55199 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ELLP55199 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ELLP55199 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ELLP55199 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ELLP55199 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ELLP55199 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ELLP55199 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ELLP55199 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ELLP55199 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ELLP55199 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ELLP55199 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ELLP55199 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ELLP55199 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ELLP55199 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ELLP55199 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ELLP55199 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ELLP55199 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ELLP55199 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ELLP55199 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
ELLP55199 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ELLP55199 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ELLP55199 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ELLP55199 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ELLP55199 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ELLP55199 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ELLP55199 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ELLP55199 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ELLP55199 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ELLP55199 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ELLP55199 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
ELLP55199 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ELLP55199 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
ELLP55199 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ELLP55199 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ELLP55199 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ELLP55199 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ELLP55199 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ELLP55199 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ELLP55199 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ELLP55199 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ELLP55199 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.18
ELLP55199 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
ELLP55199 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
ELLP55199 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ELLP55199 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ELLP55199 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ELLP55199 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ELLP55199 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ELLP55199 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ELLP55199 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ELLP55199 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ELLP55199 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ELLP55199 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ELLP55199 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ELLP55199 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ELLP55199 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ELLP55199 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ELLP55199 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ELLP55199 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ELLP55199 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ELLP55199 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ELLP55199 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ELLP55199 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ELLP55199 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ELLP55199 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ELLP55199 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ELLP55199 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ELLP55199 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ELLP55199 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ELLP55199 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ELLP55199 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ELLP55199 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ELLP55199 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.5 ms