Protein–RNA interactions for Protein: P52888

THOP1, Thimet oligopeptidase, humanhuman

Predictions only

Length 689 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
THOP1P52888 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
THOP1P52888 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
THOP1P52888 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
THOP1P52888 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
THOP1P52888 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
THOP1P52888 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
THOP1P52888 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
THOP1P52888 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
THOP1P52888 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
THOP1P52888 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
THOP1P52888 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
THOP1P52888 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
THOP1P52888 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
THOP1P52888 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
THOP1P52888 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
THOP1P52888 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
THOP1P52888 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
THOP1P52888 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
THOP1P52888 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
THOP1P52888 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
THOP1P52888 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
THOP1P52888 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
THOP1P52888 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
THOP1P52888 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
THOP1P52888 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
THOP1P52888 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
THOP1P52888 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
THOP1P52888 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
THOP1P52888 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
THOP1P52888 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
THOP1P52888 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
THOP1P52888 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
THOP1P52888 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
THOP1P52888 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
THOP1P52888 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
THOP1P52888 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
THOP1P52888 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
THOP1P52888 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
THOP1P52888 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
THOP1P52888 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
THOP1P52888 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
THOP1P52888 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
THOP1P52888 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
THOP1P52888 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
THOP1P52888 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
THOP1P52888 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
THOP1P52888 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
THOP1P52888 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
THOP1P52888 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
THOP1P52888 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
THOP1P52888 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
THOP1P52888 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
THOP1P52888 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
THOP1P52888 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
THOP1P52888 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
THOP1P52888 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
THOP1P52888 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
THOP1P52888 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
THOP1P52888 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
THOP1P52888 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
THOP1P52888 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
THOP1P52888 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
THOP1P52888 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
THOP1P52888 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
THOP1P52888 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
THOP1P52888 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
THOP1P52888 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
THOP1P52888 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
THOP1P52888 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
THOP1P52888 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
THOP1P52888 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
THOP1P52888 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
THOP1P52888 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
THOP1P52888 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
THOP1P52888 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
THOP1P52888 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
THOP1P52888 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
THOP1P52888 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
THOP1P52888 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
THOP1P52888 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
THOP1P52888 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
THOP1P52888 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
THOP1P52888 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
THOP1P52888 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
THOP1P52888 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
THOP1P52888 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
THOP1P52888 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
THOP1P52888 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
THOP1P52888 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
THOP1P52888 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
THOP1P52888 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
THOP1P52888 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
THOP1P52888 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
THOP1P52888 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
THOP1P52888 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
THOP1P52888 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
THOP1P52888 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
THOP1P52888 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
THOP1P52888 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
THOP1P52888 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.7 ms