Protein–RNA interactions for Protein: P46527

CDKN1B, Cyclin-dependent kinase inhibitor 1B, humanhuman

Predictions only

Length 198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDKN1BP46527 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CDKN1BP46527 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CDKN1BP46527 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CDKN1BP46527 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CDKN1BP46527 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CDKN1BP46527 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CDKN1BP46527 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CDKN1BP46527 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CDKN1BP46527 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CDKN1BP46527 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CDKN1BP46527 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
CDKN1BP46527 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
CDKN1BP46527 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
CDKN1BP46527 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
CDKN1BP46527 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
CDKN1BP46527 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ 0
CDKN1BP46527 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
CDKN1BP46527 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
CDKN1BP46527 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CDKN1BP46527 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
CDKN1BP46527 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CDKN1BP46527 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
CDKN1BP46527 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CDKN1BP46527 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
CDKN1BP46527 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
CDKN1BP46527 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC15.05■□□□□ -0
CDKN1BP46527 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC15.05■□□□□ -0
CDKN1BP46527 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC15.05■□□□□ -0
CDKN1BP46527 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
CDKN1BP46527 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
CDKN1BP46527 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CDKN1BP46527 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CDKN1BP46527 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
CDKN1BP46527 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CDKN1BP46527 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
CDKN1BP46527 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CDKN1BP46527 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CDKN1BP46527 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CDKN1BP46527 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
CDKN1BP46527 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CDKN1BP46527 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
CDKN1BP46527 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CDKN1BP46527 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
CDKN1BP46527 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CDKN1BP46527 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
CDKN1BP46527 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CDKN1BP46527 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CDKN1BP46527 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CDKN1BP46527 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CDKN1BP46527 PTPN5-202ENST00000396166 2299 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CDKN1BP46527 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CDKN1BP46527 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CDKN1BP46527 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CDKN1BP46527 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
CDKN1BP46527 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CDKN1BP46527 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CDKN1BP46527 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CDKN1BP46527 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
CDKN1BP46527 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC15.04■□□□□ -0
CDKN1BP46527 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC15.04■□□□□ -0
CDKN1BP46527 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CDKN1BP46527 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CDKN1BP46527 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CDKN1BP46527 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC15.04■□□□□ -0
CDKN1BP46527 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CDKN1BP46527 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CDKN1BP46527 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC15.04■□□□□ -0
CDKN1BP46527 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC15.04■□□□□ -0
CDKN1BP46527 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CDKN1BP46527 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CDKN1BP46527 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CDKN1BP46527 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CDKN1BP46527 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CDKN1BP46527 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CDKN1BP46527 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CDKN1BP46527 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CDKN1BP46527 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CDKN1BP46527 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CDKN1BP46527 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
CDKN1BP46527 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
CDKN1BP46527 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CDKN1BP46527 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
CDKN1BP46527 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CDKN1BP46527 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
CDKN1BP46527 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CDKN1BP46527 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
CDKN1BP46527 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
CDKN1BP46527 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CDKN1BP46527 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
CDKN1BP46527 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CDKN1BP46527 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CDKN1BP46527 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
CDKN1BP46527 AMN1-201ENST00000281471 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CDKN1BP46527 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CDKN1BP46527 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CDKN1BP46527 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
CDKN1BP46527 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CDKN1BP46527 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC15.03■□□□□ -0
CDKN1BP46527 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CDKN1BP46527 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.4 ms