Protein–RNA interactions for Protein: P38571

LIPA, Lysosomal acid lipase/cholesteryl ester hydrolase, humanhuman

Predictions only

Length 399 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LIPAP38571 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
LIPAP38571 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
LIPAP38571 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
LIPAP38571 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
LIPAP38571 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
LIPAP38571 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
LIPAP38571 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
LIPAP38571 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
LIPAP38571 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
LIPAP38571 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
LIPAP38571 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
LIPAP38571 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
LIPAP38571 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
LIPAP38571 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
LIPAP38571 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
LIPAP38571 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
LIPAP38571 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
LIPAP38571 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
LIPAP38571 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
LIPAP38571 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
LIPAP38571 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
LIPAP38571 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
LIPAP38571 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
LIPAP38571 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
LIPAP38571 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
LIPAP38571 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
LIPAP38571 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
LIPAP38571 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
LIPAP38571 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
LIPAP38571 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
LIPAP38571 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
LIPAP38571 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
LIPAP38571 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
LIPAP38571 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
LIPAP38571 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
LIPAP38571 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
LIPAP38571 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
LIPAP38571 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
LIPAP38571 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
LIPAP38571 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
LIPAP38571 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
LIPAP38571 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
LIPAP38571 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
LIPAP38571 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
LIPAP38571 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
LIPAP38571 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
LIPAP38571 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
LIPAP38571 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
LIPAP38571 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
LIPAP38571 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
LIPAP38571 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
LIPAP38571 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
LIPAP38571 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.09■□□□□ 0.49
LIPAP38571 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
LIPAP38571 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
LIPAP38571 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
LIPAP38571 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
LIPAP38571 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
LIPAP38571 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
LIPAP38571 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
LIPAP38571 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
LIPAP38571 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
LIPAP38571 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
LIPAP38571 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
LIPAP38571 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
LIPAP38571 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
LIPAP38571 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
LIPAP38571 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
LIPAP38571 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
LIPAP38571 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
LIPAP38571 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
LIPAP38571 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
LIPAP38571 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
LIPAP38571 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
LIPAP38571 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
LIPAP38571 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
LIPAP38571 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
LIPAP38571 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
LIPAP38571 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
LIPAP38571 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
LIPAP38571 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
LIPAP38571 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
LIPAP38571 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
LIPAP38571 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
LIPAP38571 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
LIPAP38571 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
LIPAP38571 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
LIPAP38571 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
LIPAP38571 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
LIPAP38571 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
LIPAP38571 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
LIPAP38571 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
LIPAP38571 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
LIPAP38571 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
LIPAP38571 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
LIPAP38571 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
LIPAP38571 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
LIPAP38571 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
LIPAP38571 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
LIPAP38571 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.5 ms