Protein–RNA interactions for Protein: P35226

BMI1, Polycomb complex protein BMI-1, humanhuman

Predictions only

Length 326 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BMI1P35226 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
BMI1P35226 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
BMI1P35226 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
BMI1P35226 BEND4-201ENST00000502486 8765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
BMI1P35226 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
BMI1P35226 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
BMI1P35226 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
BMI1P35226 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
BMI1P35226 ZSWIM8-213ENST00000603114 5919 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
BMI1P35226 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
BMI1P35226 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
BMI1P35226 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
BMI1P35226 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
BMI1P35226 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
BMI1P35226 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
BMI1P35226 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
BMI1P35226 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
BMI1P35226 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
BMI1P35226 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
BMI1P35226 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC15.55■□□□□ 0.08
BMI1P35226 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
BMI1P35226 FAM208B-201ENST00000328090 8626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
BMI1P35226 ADGRB2-201ENST00000373655 5400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
BMI1P35226 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
BMI1P35226 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
BMI1P35226 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
BMI1P35226 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
BMI1P35226 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
BMI1P35226 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
BMI1P35226 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
BMI1P35226 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
BMI1P35226 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
BMI1P35226 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
BMI1P35226 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
BMI1P35226 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
BMI1P35226 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
BMI1P35226 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
BMI1P35226 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
BMI1P35226 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
BMI1P35226 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
BMI1P35226 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
BMI1P35226 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
BMI1P35226 TSC2-201ENST00000219476 6156 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
BMI1P35226 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
BMI1P35226 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
BMI1P35226 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
BMI1P35226 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
BMI1P35226 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
BMI1P35226 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
BMI1P35226 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
BMI1P35226 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
BMI1P35226 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
BMI1P35226 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
BMI1P35226 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
BMI1P35226 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
BMI1P35226 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
BMI1P35226 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
BMI1P35226 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
BMI1P35226 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
BMI1P35226 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
BMI1P35226 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
BMI1P35226 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
BMI1P35226 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
BMI1P35226 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
BMI1P35226 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
BMI1P35226 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
BMI1P35226 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
BMI1P35226 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
BMI1P35226 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
BMI1P35226 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
BMI1P35226 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
BMI1P35226 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
BMI1P35226 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
BMI1P35226 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
BMI1P35226 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
BMI1P35226 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
BMI1P35226 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
BMI1P35226 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
BMI1P35226 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
BMI1P35226 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
BMI1P35226 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
BMI1P35226 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
BMI1P35226 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
BMI1P35226 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
BMI1P35226 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
BMI1P35226 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
BMI1P35226 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
BMI1P35226 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
BMI1P35226 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
BMI1P35226 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
BMI1P35226 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
BMI1P35226 SOCS7-201ENST00000612932 7857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
BMI1P35226 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
BMI1P35226 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
BMI1P35226 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
BMI1P35226 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
BMI1P35226 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
BMI1P35226 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
BMI1P35226 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
BMI1P35226 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.6 ms