Protein–RNA interactions for Protein: P32238

CCKAR, Cholecystokinin receptor type A, humanhuman

Predictions only

Length 428 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCKARP32238 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CCKARP32238 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CCKARP32238 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CCKARP32238 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CCKARP32238 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CCKARP32238 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CCKARP32238 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CCKARP32238 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CCKARP32238 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CCKARP32238 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CCKARP32238 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CCKARP32238 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CCKARP32238 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CCKARP32238 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CCKARP32238 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CCKARP32238 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CCKARP32238 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
CCKARP32238 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CCKARP32238 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CCKARP32238 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CCKARP32238 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CCKARP32238 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CCKARP32238 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CCKARP32238 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CCKARP32238 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
CCKARP32238 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CCKARP32238 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CCKARP32238 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CCKARP32238 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CCKARP32238 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CCKARP32238 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
CCKARP32238 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CCKARP32238 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CCKARP32238 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CCKARP32238 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CCKARP32238 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CCKARP32238 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CCKARP32238 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
CCKARP32238 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CCKARP32238 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CCKARP32238 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CCKARP32238 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
CCKARP32238 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CCKARP32238 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CCKARP32238 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CCKARP32238 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CCKARP32238 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CCKARP32238 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CCKARP32238 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CCKARP32238 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CCKARP32238 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CCKARP32238 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CCKARP32238 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CCKARP32238 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CCKARP32238 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CCKARP32238 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CCKARP32238 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CCKARP32238 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CCKARP32238 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CCKARP32238 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CCKARP32238 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CCKARP32238 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CCKARP32238 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CCKARP32238 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CCKARP32238 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CCKARP32238 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CCKARP32238 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CCKARP32238 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CCKARP32238 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CCKARP32238 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CCKARP32238 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CCKARP32238 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CCKARP32238 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
CCKARP32238 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CCKARP32238 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CCKARP32238 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CCKARP32238 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CCKARP32238 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
CCKARP32238 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CCKARP32238 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CCKARP32238 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
CCKARP32238 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CCKARP32238 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
CCKARP32238 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CCKARP32238 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CCKARP32238 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CCKARP32238 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CCKARP32238 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CCKARP32238 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CCKARP32238 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CCKARP32238 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CCKARP32238 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CCKARP32238 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CCKARP32238 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CCKARP32238 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
CCKARP32238 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CCKARP32238 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CCKARP32238 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CCKARP32238 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CCKARP32238 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.7 ms