Protein–RNA interactions for Protein: P31941

APOBEC3A, DNA dC->dU-editing enzyme APOBEC-3A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 199 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBEC3AP31941 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
APOBEC3AP31941 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
APOBEC3AP31941 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
APOBEC3AP31941 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
APOBEC3AP31941 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
APOBEC3AP31941 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
APOBEC3AP31941 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
APOBEC3AP31941 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
APOBEC3AP31941 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
APOBEC3AP31941 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
APOBEC3AP31941 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
APOBEC3AP31941 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
APOBEC3AP31941 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
APOBEC3AP31941 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
APOBEC3AP31941 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
APOBEC3AP31941 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
APOBEC3AP31941 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
APOBEC3AP31941 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
APOBEC3AP31941 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
APOBEC3AP31941 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
APOBEC3AP31941 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
APOBEC3AP31941 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
APOBEC3AP31941 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
APOBEC3AP31941 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
APOBEC3AP31941 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
APOBEC3AP31941 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
APOBEC3AP31941 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
APOBEC3AP31941 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
APOBEC3AP31941 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
APOBEC3AP31941 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
APOBEC3AP31941 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
APOBEC3AP31941 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
APOBEC3AP31941 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
APOBEC3AP31941 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
APOBEC3AP31941 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC17.02■□□□□ 0.32
APOBEC3AP31941 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
APOBEC3AP31941 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
APOBEC3AP31941 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
APOBEC3AP31941 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
APOBEC3AP31941 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
APOBEC3AP31941 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC17.02■□□□□ 0.31
APOBEC3AP31941 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
APOBEC3AP31941 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
APOBEC3AP31941 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
APOBEC3AP31941 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
APOBEC3AP31941 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
APOBEC3AP31941 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
APOBEC3AP31941 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
APOBEC3AP31941 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
APOBEC3AP31941 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
APOBEC3AP31941 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
APOBEC3AP31941 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
APOBEC3AP31941 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
APOBEC3AP31941 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
APOBEC3AP31941 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
APOBEC3AP31941 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
APOBEC3AP31941 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
APOBEC3AP31941 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
APOBEC3AP31941 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
APOBEC3AP31941 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
APOBEC3AP31941 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
APOBEC3AP31941 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
APOBEC3AP31941 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
APOBEC3AP31941 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
APOBEC3AP31941 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
APOBEC3AP31941 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
APOBEC3AP31941 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
APOBEC3AP31941 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
APOBEC3AP31941 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
APOBEC3AP31941 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
APOBEC3AP31941 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
APOBEC3AP31941 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
APOBEC3AP31941 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
APOBEC3AP31941 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
APOBEC3AP31941 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
APOBEC3AP31941 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
APOBEC3AP31941 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
APOBEC3AP31941 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
APOBEC3AP31941 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC17■□□□□ 0.31
APOBEC3AP31941 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
APOBEC3AP31941 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
APOBEC3AP31941 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
APOBEC3AP31941 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
APOBEC3AP31941 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
APOBEC3AP31941 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
APOBEC3AP31941 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
APOBEC3AP31941 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
APOBEC3AP31941 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
APOBEC3AP31941 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
APOBEC3AP31941 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
APOBEC3AP31941 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC17■□□□□ 0.31
APOBEC3AP31941 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
APOBEC3AP31941 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
APOBEC3AP31941 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
APOBEC3AP31941 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
APOBEC3AP31941 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
APOBEC3AP31941 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
APOBEC3AP31941 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
APOBEC3AP31941 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
APOBEC3AP31941 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.5 ms