Protein–RNA interactions for Protein: P31415

CASQ1, Calsequestrin-1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASQ1P31415 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CASQ1P31415 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CASQ1P31415 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CASQ1P31415 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CASQ1P31415 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CASQ1P31415 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CASQ1P31415 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CASQ1P31415 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CASQ1P31415 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CASQ1P31415 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CASQ1P31415 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CASQ1P31415 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CASQ1P31415 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CASQ1P31415 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CASQ1P31415 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CASQ1P31415 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CASQ1P31415 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CASQ1P31415 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CASQ1P31415 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CASQ1P31415 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CASQ1P31415 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CASQ1P31415 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CASQ1P31415 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CASQ1P31415 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CASQ1P31415 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CASQ1P31415 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
CASQ1P31415 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CASQ1P31415 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CASQ1P31415 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CASQ1P31415 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CASQ1P31415 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CASQ1P31415 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CASQ1P31415 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CASQ1P31415 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CASQ1P31415 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CASQ1P31415 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CASQ1P31415 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CASQ1P31415 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CASQ1P31415 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CASQ1P31415 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CASQ1P31415 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CASQ1P31415 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CASQ1P31415 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CASQ1P31415 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CASQ1P31415 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CASQ1P31415 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CASQ1P31415 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CASQ1P31415 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CASQ1P31415 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CASQ1P31415 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CASQ1P31415 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CASQ1P31415 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CASQ1P31415 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CASQ1P31415 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CASQ1P31415 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CASQ1P31415 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CASQ1P31415 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CASQ1P31415 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CASQ1P31415 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CASQ1P31415 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CASQ1P31415 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CASQ1P31415 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CASQ1P31415 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CASQ1P31415 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CASQ1P31415 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CASQ1P31415 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CASQ1P31415 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CASQ1P31415 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CASQ1P31415 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CASQ1P31415 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CASQ1P31415 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CASQ1P31415 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CASQ1P31415 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CASQ1P31415 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CASQ1P31415 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CASQ1P31415 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CASQ1P31415 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CASQ1P31415 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CASQ1P31415 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CASQ1P31415 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CASQ1P31415 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CASQ1P31415 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
CASQ1P31415 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CASQ1P31415 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
CASQ1P31415 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CASQ1P31415 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CASQ1P31415 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CASQ1P31415 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CASQ1P31415 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
CASQ1P31415 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CASQ1P31415 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CASQ1P31415 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CASQ1P31415 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CASQ1P31415 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
CASQ1P31415 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CASQ1P31415 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CASQ1P31415 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CASQ1P31415 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CASQ1P31415 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CASQ1P31415 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
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