Protein–RNA interactions for Protein: P30536

TSPO, Translocator protein, humanhuman

Predictions only

Length 169 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSPOP30536 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
TSPOP30536 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TSPOP30536 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TSPOP30536 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
TSPOP30536 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TSPOP30536 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
TSPOP30536 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
TSPOP30536 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TSPOP30536 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TSPOP30536 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
TSPOP30536 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
TSPOP30536 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
TSPOP30536 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
TSPOP30536 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TSPOP30536 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TSPOP30536 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TSPOP30536 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TSPOP30536 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TSPOP30536 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
TSPOP30536 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
TSPOP30536 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
TSPOP30536 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TSPOP30536 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
TSPOP30536 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
TSPOP30536 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
TSPOP30536 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
TSPOP30536 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
TSPOP30536 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
TSPOP30536 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
TSPOP30536 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
TSPOP30536 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TSPOP30536 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TSPOP30536 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
TSPOP30536 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
TSPOP30536 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC15.21■□□□□ 0.02
TSPOP30536 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
TSPOP30536 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
TSPOP30536 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TSPOP30536 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TSPOP30536 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TSPOP30536 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TSPOP30536 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TSPOP30536 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TSPOP30536 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TSPOP30536 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TSPOP30536 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TSPOP30536 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
TSPOP30536 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TSPOP30536 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TSPOP30536 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TSPOP30536 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TSPOP30536 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TSPOP30536 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TSPOP30536 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TSPOP30536 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TSPOP30536 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TSPOP30536 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TSPOP30536 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TSPOP30536 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TSPOP30536 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TSPOP30536 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TSPOP30536 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TSPOP30536 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TSPOP30536 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TSPOP30536 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TSPOP30536 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TSPOP30536 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TSPOP30536 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TSPOP30536 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TSPOP30536 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TSPOP30536 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TSPOP30536 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TSPOP30536 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TSPOP30536 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TSPOP30536 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TSPOP30536 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TSPOP30536 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TSPOP30536 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TSPOP30536 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TSPOP30536 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TSPOP30536 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TSPOP30536 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TSPOP30536 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TSPOP30536 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TSPOP30536 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
TSPOP30536 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TSPOP30536 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
TSPOP30536 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TSPOP30536 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TSPOP30536 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TSPOP30536 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TSPOP30536 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TSPOP30536 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TSPOP30536 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TSPOP30536 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
TSPOP30536 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TSPOP30536 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TSPOP30536 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TSPOP30536 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TSPOP30536 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.1 ms