Protein–RNA interactions for Protein: P26678

PLN, Cardiac phospholamban, humanhuman

Predictions only

Length 52 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLNP26678 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
PLNP26678 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
PLNP26678 TSC2-201ENST00000219476 6156 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
PLNP26678 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
PLNP26678 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
PLNP26678 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
PLNP26678 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
PLNP26678 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
PLNP26678 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
PLNP26678 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
PLNP26678 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
PLNP26678 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
PLNP26678 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
PLNP26678 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
PLNP26678 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
PLNP26678 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
PLNP26678 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
PLNP26678 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
PLNP26678 EIF4G3-205ENST00000400422 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
PLNP26678 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
PLNP26678 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
PLNP26678 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
PLNP26678 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
PLNP26678 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
PLNP26678 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
PLNP26678 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.05□□□□□ -0.16
PLNP26678 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
PLNP26678 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
PLNP26678 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
PLNP26678 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
PLNP26678 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
PLNP26678 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
PLNP26678 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
PLNP26678 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
PLNP26678 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
PLNP26678 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC14.05□□□□□ -0.16
PLNP26678 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
PLNP26678 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
PLNP26678 C6orf132-201ENST00000341865 6210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
PLNP26678 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
PLNP26678 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
PLNP26678 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
PLNP26678 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
PLNP26678 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
PLNP26678 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
PLNP26678 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
PLNP26678 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
PLNP26678 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
PLNP26678 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
PLNP26678 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
PLNP26678 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
PLNP26678 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
PLNP26678 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
PLNP26678 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
PLNP26678 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
PLNP26678 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
PLNP26678 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
PLNP26678 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
PLNP26678 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
PLNP26678 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
PLNP26678 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
PLNP26678 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
PLNP26678 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
PLNP26678 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
PLNP26678 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
PLNP26678 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
PLNP26678 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
PLNP26678 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
PLNP26678 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC14.04□□□□□ -0.16
PLNP26678 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
PLNP26678 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
PLNP26678 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
PLNP26678 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
PLNP26678 UCHL5-206ENST00000367455 5327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
PLNP26678 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
PLNP26678 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
PLNP26678 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.03□□□□□ -0.16
PLNP26678 NEO1-202ENST00000339362 7342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
PLNP26678 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
PLNP26678 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
PLNP26678 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
PLNP26678 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
PLNP26678 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC14.03□□□□□ -0.16
PLNP26678 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC14.03□□□□□ -0.16
PLNP26678 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC14.03□□□□□ -0.16
PLNP26678 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
PLNP26678 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
PLNP26678 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
PLNP26678 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.03□□□□□ -0.16
PLNP26678 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
PLNP26678 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC14.03□□□□□ -0.16
PLNP26678 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
PLNP26678 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.03□□□□□ -0.16
PLNP26678 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
PLNP26678 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
PLNP26678 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC14.03□□□□□ -0.16
PLNP26678 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
PLNP26678 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
PLNP26678 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
PLNP26678 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC14.02□□□□□ -0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.9 ms