Protein–RNA interactions for Protein: P23468

PTPRD, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase delta, humanhuman

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Length 1,912 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRDP23468 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
PTPRDP23468 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
PTPRDP23468 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
PTPRDP23468 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.94
PTPRDP23468 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.94
PTPRDP23468 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.89■□□□□ 0.94
PTPRDP23468 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
PTPRDP23468 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
PTPRDP23468 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
PTPRDP23468 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
PTPRDP23468 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
PTPRDP23468 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
PTPRDP23468 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
PTPRDP23468 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
PTPRDP23468 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
PTPRDP23468 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
PTPRDP23468 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
PTPRDP23468 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
PTPRDP23468 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
PTPRDP23468 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
PTPRDP23468 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
PTPRDP23468 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
PTPRDP23468 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC20.88■□□□□ 0.93
PTPRDP23468 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC20.88■□□□□ 0.93
PTPRDP23468 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
PTPRDP23468 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
PTPRDP23468 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
PTPRDP23468 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
PTPRDP23468 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
PTPRDP23468 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
PTPRDP23468 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
PTPRDP23468 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.88■□□□□ 0.93
PTPRDP23468 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
PTPRDP23468 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
PTPRDP23468 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
PTPRDP23468 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
PTPRDP23468 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
PTPRDP23468 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
PTPRDP23468 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
PTPRDP23468 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
PTPRDP23468 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
PTPRDP23468 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
PTPRDP23468 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
PTPRDP23468 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC20.87■□□□□ 0.93
PTPRDP23468 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
PTPRDP23468 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
PTPRDP23468 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
PTPRDP23468 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC20.87■□□□□ 0.93
PTPRDP23468 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
PTPRDP23468 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
PTPRDP23468 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
PTPRDP23468 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.87■□□□□ 0.93
PTPRDP23468 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
PTPRDP23468 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
PTPRDP23468 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
PTPRDP23468 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
PTPRDP23468 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
PTPRDP23468 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
PTPRDP23468 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
PTPRDP23468 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC20.86■□□□□ 0.93
PTPRDP23468 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
PTPRDP23468 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
PTPRDP23468 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
PTPRDP23468 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
PTPRDP23468 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
PTPRDP23468 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
PTPRDP23468 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
PTPRDP23468 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
PTPRDP23468 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
PTPRDP23468 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
PTPRDP23468 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
PTPRDP23468 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
PTPRDP23468 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
PTPRDP23468 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
PTPRDP23468 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
PTPRDP23468 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
PTPRDP23468 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
PTPRDP23468 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
PTPRDP23468 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
PTPRDP23468 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
PTPRDP23468 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
PTPRDP23468 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
PTPRDP23468 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
PTPRDP23468 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
PTPRDP23468 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
PTPRDP23468 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
PTPRDP23468 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
PTPRDP23468 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
PTPRDP23468 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
PTPRDP23468 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
PTPRDP23468 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
PTPRDP23468 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
PTPRDP23468 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
PTPRDP23468 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
PTPRDP23468 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
PTPRDP23468 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
PTPRDP23468 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
PTPRDP23468 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
PTPRDP23468 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
PTPRDP23468 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
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