Protein–RNA interactions for Protein: P21709

EPHA1, Ephrin type-A receptor 1, humanhuman

Predictions only

Length 976 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EPHA1P21709 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
EPHA1P21709 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
EPHA1P21709 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
EPHA1P21709 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
EPHA1P21709 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.01■□□□□ 0.31
EPHA1P21709 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
EPHA1P21709 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
EPHA1P21709 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
EPHA1P21709 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
EPHA1P21709 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
EPHA1P21709 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
EPHA1P21709 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
EPHA1P21709 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
EPHA1P21709 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
EPHA1P21709 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
EPHA1P21709 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
EPHA1P21709 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
EPHA1P21709 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
EPHA1P21709 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
EPHA1P21709 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
EPHA1P21709 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
EPHA1P21709 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
EPHA1P21709 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
EPHA1P21709 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
EPHA1P21709 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
EPHA1P21709 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
EPHA1P21709 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
EPHA1P21709 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
EPHA1P21709 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
EPHA1P21709 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
EPHA1P21709 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
EPHA1P21709 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
EPHA1P21709 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
EPHA1P21709 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
EPHA1P21709 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
EPHA1P21709 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
EPHA1P21709 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
EPHA1P21709 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
EPHA1P21709 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC17■□□□□ 0.31
EPHA1P21709 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
EPHA1P21709 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC17■□□□□ 0.31
EPHA1P21709 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
EPHA1P21709 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
EPHA1P21709 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
EPHA1P21709 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
EPHA1P21709 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
EPHA1P21709 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
EPHA1P21709 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
EPHA1P21709 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
EPHA1P21709 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
EPHA1P21709 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
EPHA1P21709 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
EPHA1P21709 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
EPHA1P21709 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
EPHA1P21709 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
EPHA1P21709 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
EPHA1P21709 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
EPHA1P21709 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
EPHA1P21709 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
EPHA1P21709 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
EPHA1P21709 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
EPHA1P21709 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
EPHA1P21709 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
EPHA1P21709 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
EPHA1P21709 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
EPHA1P21709 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
EPHA1P21709 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
EPHA1P21709 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
EPHA1P21709 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
EPHA1P21709 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
EPHA1P21709 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
EPHA1P21709 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
EPHA1P21709 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
EPHA1P21709 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
EPHA1P21709 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
EPHA1P21709 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
EPHA1P21709 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
EPHA1P21709 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
EPHA1P21709 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
EPHA1P21709 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
EPHA1P21709 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
EPHA1P21709 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
EPHA1P21709 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
EPHA1P21709 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC16.98■□□□□ 0.31
EPHA1P21709 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
EPHA1P21709 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
EPHA1P21709 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
EPHA1P21709 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
EPHA1P21709 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
EPHA1P21709 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
EPHA1P21709 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
EPHA1P21709 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
EPHA1P21709 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
EPHA1P21709 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
EPHA1P21709 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
EPHA1P21709 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
EPHA1P21709 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
EPHA1P21709 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
EPHA1P21709 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
EPHA1P21709 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.5 ms