Protein–RNA interactions for Protein: P13866

SLC5A1, Sodium/glucose cotransporter 1, humanhuman

Predictions only

Length 664 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC5A1P13866 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SLC5A1P13866 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SLC5A1P13866 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SLC5A1P13866 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SLC5A1P13866 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SLC5A1P13866 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SLC5A1P13866 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SLC5A1P13866 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SLC5A1P13866 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SLC5A1P13866 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SLC5A1P13866 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SLC5A1P13866 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SLC5A1P13866 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SLC5A1P13866 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SLC5A1P13866 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SLC5A1P13866 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SLC5A1P13866 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SLC5A1P13866 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SLC5A1P13866 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
SLC5A1P13866 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SLC5A1P13866 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.48
SLC5A1P13866 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC24.33■■□□□ 1.48
SLC5A1P13866 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SLC5A1P13866 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SLC5A1P13866 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SLC5A1P13866 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SLC5A1P13866 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SLC5A1P13866 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SLC5A1P13866 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
SLC5A1P13866 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SLC5A1P13866 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SLC5A1P13866 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SLC5A1P13866 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SLC5A1P13866 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SLC5A1P13866 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SLC5A1P13866 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SLC5A1P13866 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SLC5A1P13866 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SLC5A1P13866 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SLC5A1P13866 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SLC5A1P13866 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SLC5A1P13866 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SLC5A1P13866 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SLC5A1P13866 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SLC5A1P13866 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SLC5A1P13866 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SLC5A1P13866 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SLC5A1P13866 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SLC5A1P13866 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SLC5A1P13866 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SLC5A1P13866 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SLC5A1P13866 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SLC5A1P13866 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SLC5A1P13866 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SLC5A1P13866 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
SLC5A1P13866 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SLC5A1P13866 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SLC5A1P13866 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SLC5A1P13866 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SLC5A1P13866 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SLC5A1P13866 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SLC5A1P13866 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SLC5A1P13866 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SLC5A1P13866 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SLC5A1P13866 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SLC5A1P13866 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SLC5A1P13866 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SLC5A1P13866 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SLC5A1P13866 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SLC5A1P13866 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SLC5A1P13866 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SLC5A1P13866 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SLC5A1P13866 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SLC5A1P13866 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SLC5A1P13866 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SLC5A1P13866 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SLC5A1P13866 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SLC5A1P13866 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SLC5A1P13866 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SLC5A1P13866 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SLC5A1P13866 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SLC5A1P13866 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SLC5A1P13866 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SLC5A1P13866 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
SLC5A1P13866 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SLC5A1P13866 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
SLC5A1P13866 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SLC5A1P13866 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SLC5A1P13866 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SLC5A1P13866 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SLC5A1P13866 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SLC5A1P13866 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SLC5A1P13866 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SLC5A1P13866 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SLC5A1P13866 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SLC5A1P13866 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SLC5A1P13866 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SLC5A1P13866 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SLC5A1P13866 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SLC5A1P13866 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.5 ms