Protein–RNA interactions for Protein: P0DP09

IGKV1-13, Immunoglobulin kappa variable 1-13, humanhuman

Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGKV1-13P0DP09 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
IGKV1-13P0DP09 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
IGKV1-13P0DP09 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
IGKV1-13P0DP09 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
IGKV1-13P0DP09 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
IGKV1-13P0DP09 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
IGKV1-13P0DP09 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
IGKV1-13P0DP09 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
IGKV1-13P0DP09 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
IGKV1-13P0DP09 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
IGKV1-13P0DP09 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
IGKV1-13P0DP09 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
IGKV1-13P0DP09 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
IGKV1-13P0DP09 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
IGKV1-13P0DP09 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
IGKV1-13P0DP09 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
IGKV1-13P0DP09 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
IGKV1-13P0DP09 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
IGKV1-13P0DP09 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
IGKV1-13P0DP09 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
IGKV1-13P0DP09 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
IGKV1-13P0DP09 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
IGKV1-13P0DP09 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
IGKV1-13P0DP09 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
IGKV1-13P0DP09 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
IGKV1-13P0DP09 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
IGKV1-13P0DP09 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
IGKV1-13P0DP09 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
IGKV1-13P0DP09 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
IGKV1-13P0DP09 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
IGKV1-13P0DP09 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
IGKV1-13P0DP09 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
IGKV1-13P0DP09 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
IGKV1-13P0DP09 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
IGKV1-13P0DP09 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
IGKV1-13P0DP09 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
IGKV1-13P0DP09 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
IGKV1-13P0DP09 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
IGKV1-13P0DP09 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
IGKV1-13P0DP09 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
IGKV1-13P0DP09 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
IGKV1-13P0DP09 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
IGKV1-13P0DP09 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
IGKV1-13P0DP09 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
IGKV1-13P0DP09 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
IGKV1-13P0DP09 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
IGKV1-13P0DP09 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
IGKV1-13P0DP09 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
IGKV1-13P0DP09 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
IGKV1-13P0DP09 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
IGKV1-13P0DP09 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
IGKV1-13P0DP09 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
IGKV1-13P0DP09 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
IGKV1-13P0DP09 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
IGKV1-13P0DP09 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
IGKV1-13P0DP09 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
IGKV1-13P0DP09 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
IGKV1-13P0DP09 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
IGKV1-13P0DP09 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
IGKV1-13P0DP09 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
IGKV1-13P0DP09 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
IGKV1-13P0DP09 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
IGKV1-13P0DP09 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
IGKV1-13P0DP09 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
IGKV1-13P0DP09 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
IGKV1-13P0DP09 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
IGKV1-13P0DP09 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
IGKV1-13P0DP09 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
IGKV1-13P0DP09 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
IGKV1-13P0DP09 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
IGKV1-13P0DP09 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
IGKV1-13P0DP09 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
IGKV1-13P0DP09 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
IGKV1-13P0DP09 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
IGKV1-13P0DP09 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
IGKV1-13P0DP09 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
IGKV1-13P0DP09 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
IGKV1-13P0DP09 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
IGKV1-13P0DP09 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
IGKV1-13P0DP09 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
IGKV1-13P0DP09 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
IGKV1-13P0DP09 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
IGKV1-13P0DP09 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
IGKV1-13P0DP09 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
IGKV1-13P0DP09 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
IGKV1-13P0DP09 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
IGKV1-13P0DP09 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
IGKV1-13P0DP09 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
IGKV1-13P0DP09 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
IGKV1-13P0DP09 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
IGKV1-13P0DP09 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
IGKV1-13P0DP09 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
IGKV1-13P0DP09 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
IGKV1-13P0DP09 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
IGKV1-13P0DP09 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
IGKV1-13P0DP09 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
IGKV1-13P0DP09 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
IGKV1-13P0DP09 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
IGKV1-13P0DP09 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
IGKV1-13P0DP09 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.1 ms