Protein–RNA interactions for Protein: P0C7M3

SFTA3, Surfactant-associated protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 94 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFTA3P0C7M3 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SFTA3P0C7M3 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SFTA3P0C7M3 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SFTA3P0C7M3 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SFTA3P0C7M3 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SFTA3P0C7M3 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SFTA3P0C7M3 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SFTA3P0C7M3 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SFTA3P0C7M3 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SFTA3P0C7M3 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SFTA3P0C7M3 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SFTA3P0C7M3 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
SFTA3P0C7M3 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SFTA3P0C7M3 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SFTA3P0C7M3 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SFTA3P0C7M3 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SFTA3P0C7M3 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SFTA3P0C7M3 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SFTA3P0C7M3 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SFTA3P0C7M3 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SFTA3P0C7M3 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
SFTA3P0C7M3 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
SFTA3P0C7M3 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SFTA3P0C7M3 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SFTA3P0C7M3 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SFTA3P0C7M3 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SFTA3P0C7M3 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SFTA3P0C7M3 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SFTA3P0C7M3 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SFTA3P0C7M3 ADCY6-202ENST00000357869 5748 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SFTA3P0C7M3 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SFTA3P0C7M3 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SFTA3P0C7M3 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SFTA3P0C7M3 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SFTA3P0C7M3 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SFTA3P0C7M3 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SFTA3P0C7M3 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SFTA3P0C7M3 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SFTA3P0C7M3 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SFTA3P0C7M3 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SFTA3P0C7M3 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SFTA3P0C7M3 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SFTA3P0C7M3 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SFTA3P0C7M3 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SFTA3P0C7M3 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SFTA3P0C7M3 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SFTA3P0C7M3 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SFTA3P0C7M3 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SFTA3P0C7M3 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SFTA3P0C7M3 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SFTA3P0C7M3 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SFTA3P0C7M3 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SFTA3P0C7M3 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SFTA3P0C7M3 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SFTA3P0C7M3 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SFTA3P0C7M3 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SFTA3P0C7M3 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SFTA3P0C7M3 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SFTA3P0C7M3 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SFTA3P0C7M3 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SFTA3P0C7M3 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SFTA3P0C7M3 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SFTA3P0C7M3 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SFTA3P0C7M3 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SFTA3P0C7M3 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SFTA3P0C7M3 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SFTA3P0C7M3 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SFTA3P0C7M3 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SFTA3P0C7M3 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SFTA3P0C7M3 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SFTA3P0C7M3 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SFTA3P0C7M3 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
SFTA3P0C7M3 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SFTA3P0C7M3 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SFTA3P0C7M3 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SFTA3P0C7M3 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SFTA3P0C7M3 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SFTA3P0C7M3 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SFTA3P0C7M3 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SFTA3P0C7M3 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SFTA3P0C7M3 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SFTA3P0C7M3 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SFTA3P0C7M3 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SFTA3P0C7M3 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SFTA3P0C7M3 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SFTA3P0C7M3 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SFTA3P0C7M3 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SFTA3P0C7M3 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SFTA3P0C7M3 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SFTA3P0C7M3 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SFTA3P0C7M3 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SFTA3P0C7M3 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SFTA3P0C7M3 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SFTA3P0C7M3 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SFTA3P0C7M3 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SFTA3P0C7M3 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SFTA3P0C7M3 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SFTA3P0C7M3 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SFTA3P0C7M3 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SFTA3P0C7M3 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.9 ms