Protein–RNA interactions for Protein: P09629

HOXB7, Homeobox protein Hox-B7, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB7P09629 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
HOXB7P09629 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
HOXB7P09629 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
HOXB7P09629 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
HOXB7P09629 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
HOXB7P09629 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
HOXB7P09629 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
HOXB7P09629 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
HOXB7P09629 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
HOXB7P09629 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
HOXB7P09629 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
HOXB7P09629 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
HOXB7P09629 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
HOXB7P09629 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
HOXB7P09629 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
HOXB7P09629 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
HOXB7P09629 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
HOXB7P09629 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
HOXB7P09629 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
HOXB7P09629 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
HOXB7P09629 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
HOXB7P09629 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
HOXB7P09629 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
HOXB7P09629 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
HOXB7P09629 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
HOXB7P09629 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
HOXB7P09629 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC25.43■■□□□ 1.66
HOXB7P09629 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
HOXB7P09629 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
HOXB7P09629 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
HOXB7P09629 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
HOXB7P09629 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
HOXB7P09629 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
HOXB7P09629 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
HOXB7P09629 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
HOXB7P09629 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
HOXB7P09629 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
HOXB7P09629 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
HOXB7P09629 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
HOXB7P09629 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
HOXB7P09629 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
HOXB7P09629 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
HOXB7P09629 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
HOXB7P09629 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
HOXB7P09629 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
HOXB7P09629 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
HOXB7P09629 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
HOXB7P09629 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
HOXB7P09629 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
HOXB7P09629 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
HOXB7P09629 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
HOXB7P09629 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
HOXB7P09629 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
HOXB7P09629 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
HOXB7P09629 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
HOXB7P09629 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
HOXB7P09629 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
HOXB7P09629 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
HOXB7P09629 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
HOXB7P09629 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
HOXB7P09629 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
HOXB7P09629 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
HOXB7P09629 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
HOXB7P09629 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
HOXB7P09629 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
HOXB7P09629 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
HOXB7P09629 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
HOXB7P09629 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC25.41■■□□□ 1.66
HOXB7P09629 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
HOXB7P09629 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
HOXB7P09629 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
HOXB7P09629 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
HOXB7P09629 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
HOXB7P09629 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
HOXB7P09629 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
HOXB7P09629 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
HOXB7P09629 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
HOXB7P09629 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
HOXB7P09629 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
HOXB7P09629 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
HOXB7P09629 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
HOXB7P09629 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
HOXB7P09629 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
HOXB7P09629 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
HOXB7P09629 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
HOXB7P09629 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
HOXB7P09629 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
HOXB7P09629 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
HOXB7P09629 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
HOXB7P09629 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
HOXB7P09629 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
HOXB7P09629 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
HOXB7P09629 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
HOXB7P09629 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
HOXB7P09629 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
HOXB7P09629 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
HOXB7P09629 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
HOXB7P09629 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
HOXB7P09629 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC25.38■■□□□ 1.65
HOXB7P09629 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.8 ms