Protein–RNA interactions for Protein: P09110

ACAA1, 3-ketoacyl-CoA thiolase, peroxisomal, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 424 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACAA1P09110 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ACAA1P09110 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ACAA1P09110 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ACAA1P09110 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ACAA1P09110 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ACAA1P09110 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ACAA1P09110 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ACAA1P09110 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ACAA1P09110 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
ACAA1P09110 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
ACAA1P09110 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ACAA1P09110 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ACAA1P09110 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
ACAA1P09110 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
ACAA1P09110 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
ACAA1P09110 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ACAA1P09110 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
ACAA1P09110 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC17.04■□□□□ 0.32
ACAA1P09110 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
ACAA1P09110 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
ACAA1P09110 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ACAA1P09110 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ACAA1P09110 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ACAA1P09110 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ACAA1P09110 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ACAA1P09110 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
ACAA1P09110 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
ACAA1P09110 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ACAA1P09110 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ACAA1P09110 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ACAA1P09110 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
ACAA1P09110 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
ACAA1P09110 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ACAA1P09110 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ACAA1P09110 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ACAA1P09110 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ACAA1P09110 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ACAA1P09110 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ACAA1P09110 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ACAA1P09110 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ACAA1P09110 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ACAA1P09110 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ACAA1P09110 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ACAA1P09110 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
ACAA1P09110 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ACAA1P09110 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ACAA1P09110 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ACAA1P09110 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ACAA1P09110 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ACAA1P09110 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ACAA1P09110 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ACAA1P09110 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ACAA1P09110 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ACAA1P09110 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
ACAA1P09110 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
ACAA1P09110 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
ACAA1P09110 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
ACAA1P09110 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
ACAA1P09110 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
ACAA1P09110 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.32
ACAA1P09110 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
ACAA1P09110 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
ACAA1P09110 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
ACAA1P09110 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
ACAA1P09110 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
ACAA1P09110 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC17.02■□□□□ 0.32
ACAA1P09110 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
ACAA1P09110 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
ACAA1P09110 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
ACAA1P09110 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
ACAA1P09110 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
ACAA1P09110 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
ACAA1P09110 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC17.02■□□□□ 0.32
ACAA1P09110 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
ACAA1P09110 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
ACAA1P09110 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
ACAA1P09110 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
ACAA1P09110 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
ACAA1P09110 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
ACAA1P09110 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ACAA1P09110 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ACAA1P09110 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ACAA1P09110 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ACAA1P09110 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ACAA1P09110 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ACAA1P09110 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ACAA1P09110 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ACAA1P09110 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ACAA1P09110 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
ACAA1P09110 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
ACAA1P09110 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ACAA1P09110 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ACAA1P09110 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ACAA1P09110 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ACAA1P09110 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ACAA1P09110 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ACAA1P09110 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ACAA1P09110 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ACAA1P09110 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
ACAA1P09110 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.3 ms