Protein–RNA interactions for Protein: P08240

SRPRA, Signal recognition particle receptor subunit alpha, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 638 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRPRAP08240 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SRPRAP08240 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SRPRAP08240 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SRPRAP08240 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SRPRAP08240 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SRPRAP08240 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SRPRAP08240 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SRPRAP08240 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SRPRAP08240 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SRPRAP08240 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SRPRAP08240 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SRPRAP08240 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SRPRAP08240 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SRPRAP08240 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SRPRAP08240 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SRPRAP08240 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SRPRAP08240 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SRPRAP08240 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SRPRAP08240 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SRPRAP08240 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SRPRAP08240 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SRPRAP08240 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SRPRAP08240 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SRPRAP08240 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SRPRAP08240 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SRPRAP08240 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SRPRAP08240 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SRPRAP08240 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SRPRAP08240 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SRPRAP08240 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
SRPRAP08240 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SRPRAP08240 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SRPRAP08240 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SRPRAP08240 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SRPRAP08240 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SRPRAP08240 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SRPRAP08240 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SRPRAP08240 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SRPRAP08240 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SRPRAP08240 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SRPRAP08240 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SRPRAP08240 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SRPRAP08240 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SRPRAP08240 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SRPRAP08240 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SRPRAP08240 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SRPRAP08240 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
SRPRAP08240 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SRPRAP08240 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SRPRAP08240 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SRPRAP08240 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SRPRAP08240 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SRPRAP08240 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SRPRAP08240 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SRPRAP08240 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SRPRAP08240 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SRPRAP08240 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SRPRAP08240 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SRPRAP08240 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SRPRAP08240 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SRPRAP08240 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SRPRAP08240 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SRPRAP08240 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
SRPRAP08240 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SRPRAP08240 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SRPRAP08240 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SRPRAP08240 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SRPRAP08240 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SRPRAP08240 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SRPRAP08240 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SRPRAP08240 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SRPRAP08240 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SRPRAP08240 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SRPRAP08240 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SRPRAP08240 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SRPRAP08240 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SRPRAP08240 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SRPRAP08240 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SRPRAP08240 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SRPRAP08240 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SRPRAP08240 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SRPRAP08240 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SRPRAP08240 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
SRPRAP08240 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SRPRAP08240 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SRPRAP08240 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SRPRAP08240 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SRPRAP08240 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SRPRAP08240 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
SRPRAP08240 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SRPRAP08240 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SRPRAP08240 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SRPRAP08240 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SRPRAP08240 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SRPRAP08240 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SRPRAP08240 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SRPRAP08240 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SRPRAP08240 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SRPRAP08240 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SRPRAP08240 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.3 ms