Protein–RNA interactions for Protein: P05386

RPLP1, 60S acidic ribosomal protein P1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 114 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPLP1P05386 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RPLP1P05386 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
RPLP1P05386 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RPLP1P05386 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RPLP1P05386 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RPLP1P05386 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RPLP1P05386 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RPLP1P05386 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RPLP1P05386 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RPLP1P05386 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RPLP1P05386 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RPLP1P05386 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RPLP1P05386 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RPLP1P05386 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RPLP1P05386 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RPLP1P05386 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RPLP1P05386 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RPLP1P05386 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RPLP1P05386 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RPLP1P05386 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RPLP1P05386 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RPLP1P05386 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RPLP1P05386 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RPLP1P05386 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RPLP1P05386 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RPLP1P05386 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RPLP1P05386 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RPLP1P05386 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RPLP1P05386 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RPLP1P05386 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RPLP1P05386 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RPLP1P05386 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RPLP1P05386 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RPLP1P05386 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RPLP1P05386 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RPLP1P05386 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RPLP1P05386 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RPLP1P05386 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RPLP1P05386 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RPLP1P05386 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RPLP1P05386 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
RPLP1P05386 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RPLP1P05386 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RPLP1P05386 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RPLP1P05386 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RPLP1P05386 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RPLP1P05386 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RPLP1P05386 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
RPLP1P05386 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RPLP1P05386 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RPLP1P05386 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
RPLP1P05386 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
RPLP1P05386 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RPLP1P05386 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RPLP1P05386 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RPLP1P05386 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RPLP1P05386 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RPLP1P05386 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RPLP1P05386 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RPLP1P05386 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RPLP1P05386 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RPLP1P05386 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RPLP1P05386 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RPLP1P05386 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RPLP1P05386 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RPLP1P05386 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RPLP1P05386 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RPLP1P05386 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RPLP1P05386 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RPLP1P05386 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RPLP1P05386 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RPLP1P05386 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RPLP1P05386 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
RPLP1P05386 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RPLP1P05386 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RPLP1P05386 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RPLP1P05386 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RPLP1P05386 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RPLP1P05386 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
RPLP1P05386 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RPLP1P05386 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RPLP1P05386 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RPLP1P05386 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RPLP1P05386 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
RPLP1P05386 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RPLP1P05386 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RPLP1P05386 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RPLP1P05386 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RPLP1P05386 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RPLP1P05386 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RPLP1P05386 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RPLP1P05386 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RPLP1P05386 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RPLP1P05386 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
RPLP1P05386 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RPLP1P05386 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RPLP1P05386 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RPLP1P05386 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
RPLP1P05386 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RPLP1P05386 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.4 ms