Protein–RNA interactions for Protein: P01780

IGHV3-7, Immunoglobulin heavy variable 3-7, humanhuman

Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGHV3-7P01780 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
IGHV3-7P01780 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
IGHV3-7P01780 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
IGHV3-7P01780 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
IGHV3-7P01780 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
IGHV3-7P01780 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
IGHV3-7P01780 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
IGHV3-7P01780 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
IGHV3-7P01780 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
IGHV3-7P01780 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
IGHV3-7P01780 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
IGHV3-7P01780 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
IGHV3-7P01780 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
IGHV3-7P01780 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
IGHV3-7P01780 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC16.52■□□□□ 0.24
IGHV3-7P01780 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
IGHV3-7P01780 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
IGHV3-7P01780 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
IGHV3-7P01780 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
IGHV3-7P01780 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
IGHV3-7P01780 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
IGHV3-7P01780 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
IGHV3-7P01780 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
IGHV3-7P01780 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
IGHV3-7P01780 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
IGHV3-7P01780 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
IGHV3-7P01780 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
IGHV3-7P01780 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
IGHV3-7P01780 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
IGHV3-7P01780 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
IGHV3-7P01780 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
IGHV3-7P01780 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
IGHV3-7P01780 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
IGHV3-7P01780 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
IGHV3-7P01780 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
IGHV3-7P01780 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
IGHV3-7P01780 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
IGHV3-7P01780 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
IGHV3-7P01780 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
IGHV3-7P01780 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
IGHV3-7P01780 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
IGHV3-7P01780 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
IGHV3-7P01780 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
IGHV3-7P01780 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
IGHV3-7P01780 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
IGHV3-7P01780 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
IGHV3-7P01780 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
IGHV3-7P01780 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
IGHV3-7P01780 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
IGHV3-7P01780 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
IGHV3-7P01780 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
IGHV3-7P01780 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
IGHV3-7P01780 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
IGHV3-7P01780 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
IGHV3-7P01780 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
IGHV3-7P01780 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
IGHV3-7P01780 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
IGHV3-7P01780 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
IGHV3-7P01780 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
IGHV3-7P01780 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
IGHV3-7P01780 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
IGHV3-7P01780 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
IGHV3-7P01780 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
IGHV3-7P01780 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
IGHV3-7P01780 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
IGHV3-7P01780 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
IGHV3-7P01780 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
IGHV3-7P01780 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
IGHV3-7P01780 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
IGHV3-7P01780 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
IGHV3-7P01780 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
IGHV3-7P01780 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
IGHV3-7P01780 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
IGHV3-7P01780 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
IGHV3-7P01780 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
IGHV3-7P01780 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
IGHV3-7P01780 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
IGHV3-7P01780 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
IGHV3-7P01780 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
IGHV3-7P01780 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
IGHV3-7P01780 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
IGHV3-7P01780 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
IGHV3-7P01780 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
IGHV3-7P01780 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
IGHV3-7P01780 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
IGHV3-7P01780 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
IGHV3-7P01780 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
IGHV3-7P01780 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
IGHV3-7P01780 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
IGHV3-7P01780 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
IGHV3-7P01780 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
IGHV3-7P01780 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
IGHV3-7P01780 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
IGHV3-7P01780 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
IGHV3-7P01780 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
IGHV3-7P01780 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
IGHV3-7P01780 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
IGHV3-7P01780 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
IGHV3-7P01780 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
IGHV3-7P01780 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.8 ms