Protein–RNA interactions for Protein: O95983

MBD3, Methyl-CpG-binding domain protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 291 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MBD3O95983 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
MBD3O95983 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
MBD3O95983 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
MBD3O95983 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
MBD3O95983 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
MBD3O95983 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
MBD3O95983 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
MBD3O95983 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
MBD3O95983 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
MBD3O95983 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
MBD3O95983 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
MBD3O95983 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
MBD3O95983 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
MBD3O95983 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
MBD3O95983 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
MBD3O95983 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
MBD3O95983 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
MBD3O95983 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
MBD3O95983 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
MBD3O95983 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
MBD3O95983 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
MBD3O95983 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
MBD3O95983 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
MBD3O95983 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
MBD3O95983 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
MBD3O95983 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
MBD3O95983 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC22.83■■□□□ 1.25
MBD3O95983 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC22.83■■□□□ 1.25
MBD3O95983 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
MBD3O95983 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
MBD3O95983 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
MBD3O95983 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
MBD3O95983 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
MBD3O95983 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
MBD3O95983 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
MBD3O95983 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
MBD3O95983 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
MBD3O95983 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
MBD3O95983 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
MBD3O95983 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
MBD3O95983 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
MBD3O95983 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
MBD3O95983 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
MBD3O95983 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
MBD3O95983 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
MBD3O95983 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
MBD3O95983 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
MBD3O95983 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC22.82■■□□□ 1.24
MBD3O95983 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
MBD3O95983 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
MBD3O95983 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
MBD3O95983 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
MBD3O95983 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
MBD3O95983 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
MBD3O95983 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
MBD3O95983 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
MBD3O95983 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
MBD3O95983 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
MBD3O95983 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
MBD3O95983 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
MBD3O95983 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
MBD3O95983 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
MBD3O95983 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
MBD3O95983 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
MBD3O95983 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
MBD3O95983 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
MBD3O95983 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
MBD3O95983 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
MBD3O95983 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
MBD3O95983 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
MBD3O95983 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
MBD3O95983 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
MBD3O95983 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
MBD3O95983 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
MBD3O95983 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
MBD3O95983 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
MBD3O95983 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
MBD3O95983 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
MBD3O95983 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
MBD3O95983 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
MBD3O95983 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
MBD3O95983 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
MBD3O95983 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
MBD3O95983 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
MBD3O95983 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
MBD3O95983 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
MBD3O95983 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
MBD3O95983 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
MBD3O95983 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
MBD3O95983 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
MBD3O95983 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
MBD3O95983 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
MBD3O95983 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
MBD3O95983 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
MBD3O95983 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
MBD3O95983 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
MBD3O95983 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
MBD3O95983 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
MBD3O95983 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
MBD3O95983 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.3 ms